1.财务报表本身的局限性
财务报表是会计的产物，会计有特定的假设前提，并要执行统一的规范。我们只能在规定意义上使用报表数据，不能认为报表揭示了企业的全部实际情况。
财务报表的局限性表现在：
（1）以历史成本报告资产，不代表其现行成本或变现价值。
（2）假设币值不变，不按通货膨胀率或物价水平调整。
（3）稳健原则要求预计损失而不预计收益，有可能夸大费用，少计收益和资产。
（4）按年度分期报告，只报告了短期信息，不能提供反映长期潜在的信息。
2.财务报表的真实性问题
应当说，只有根据真实的财务报表，才有可能得出正确的分析结论。财务分析通常假定报表是真实的。报表的真实性问题，要靠审计来解决。
财务分析不能解决报表的真实性问题，但是财务分析人员通常要注意以下与此有关的问题：
（1）要注意财务报告是否规范。
不规范的报告，其真实性也应受到怀疑。
（2）要注意财务报告是否有遗漏。
遗漏是违背充分披露原则的。遗漏很可能是在不想讲真话、也不能说假话的情况下形成的。
（3）要注意分析数据的反常现象。
如无合理的反常原因，则要考虑数据的真实性和一贯性是否有问题。
（4）要注意审计报告的意见及注册会计师的信誉。
3.企业会计政策的不同选择影响可比性
对同一会计事项的账务处理，会计准则允许使用几种不同的规则和程序，企业可以自行选择。例如，存货计价方法、折旧方法、所得税费用的确认方法、对外投资收益的确认方法等。
虽然财务报表附注对会计政策的选择有一定的表述，但报表使用人未必能完成可比性的调整工作。
4.比较基础问题
在比较分析时，必须要选择比较的基础，作为评价本企业当期实际数据的参照标准，包括本企业历史数据、同业数据和计划预算数据。
横向比较时使用同业标准。同业的平均数，只起一般性的指导作用，不一定有代表性，不是合理性的标志。通常，不如选一组有代表性的企业求其平均数，作为同业标准，可能比整个行业的平均数更好。近年来，更重视以竞争对手的数据作为分析基础。有的企业实行多种经营，没有明确的行业归属，同业对比就更困难。
趋势分析以本企业历史数据作比较基础。历史数据代表过去，并不代表合理性。经营的环境是变化的，今年比去年利润提高了，不一定说明已经达到应该达到的水平，甚至不一定说明管理有了改进。
实际与计划的差异分析，以计划预算做比较基础。实际和预算的差异，有时是预算不合理造成的，而不是执行中有了什么问题。
总之，对比较基础本身要准确理解，并且要在限定意义上使用分析结论，避免简单化和绝对化。
