八国联军进入了北京城，慈禧要跑了，而一直不听话的珍妃该怎么办呢？于是一条恶毒的计策出现了，“去，把珍妃带来。”珍妃被带了上来，这时的珍妃自己不再是当年艳冠后宫的美人，只见她长发披肩，脸色清白，消瘦了许多，衣服也抓的破破烂烂，众人都大吃一惊，尤其是光绪帝心如刀绞，恨不得冲过去搂住珍妃。
慈禧让珍妃准备行装西逃，珍妃却木然地站在那里，慈禧生气地指着珍妃：“天下都被你们弄成这个样子，你还愣着干什么？难道还想留下狐媚洋人不成？”
珍妃看了一眼慈禧，从容地问：“万岁爷呢？万岁爷也走吗？”
慈禧心急如焚，不愿多耽误时间：“混帐话！万岁爷怎么能留下，他是社稷之主！”
珍妃缓缓跪下：“我有一言禀告太后，皇帝乃一国之主，应以社稷为重，岂能弃万民于不顾，正宜在京与洋人交涉，陈说利害，晓以大义，太后可暂时避一避洋人的凶焰。我愿留下来伺候皇上，等事情稍有平息后，再迎接太后回来秉政。”
慈禧耐着性子听珍妃说完，冷笑一声：“你倒是忠心一片，你自己愿意留下，老身也不勉强，只是皇上乃一国之主，决不能留下，你呢，老身给你找个好去处。”她转身向二总管崔玉贵耳语几句，崔玉贵冷笑着向珍妃走去。
珍妃预感到要发生什么事情，长跪在地不起，皇上吓坏了，跪在地上一个劲地磕头，求慈禧：“亲爸爸，珍妃年幼无知，冒犯了您，您就饶了她吧！求您饶了她一命！”
慈禧望着皇上，怒不可遏：“你还替她讲情，都是她这个狐狸精迷的你，她早就该死了，我要带她走，她不走，再说我看见她就生气！让她留下，城里这么乱，她年经轻轻的，万一被污，岂不是坏了皇家的名声，还不快带下去！”
崔玉贵一声“喳”，一把抓住珍妃的胳脯，两个小太监挟着珍妃，来到宁寿宫，崔玉贵把珍妃拖到后门那口井边，示意两个小太监动手，两个小太监实在不忍心，两眼含泪，站着没动。崔玉贵责骂了一声，拦腰抱起了珍妃，任凭她抓他、挠他、咬他，浑然不觉，一猛劲把珍妃扔进了井中。
皇上发疯似地冲了上去，大声喊着：“救命呀！救命呀！”其他太监抱住皇上，不让他上前，可光绪帝不知哪来的那么大力气，猛地摆脱了众人，飞步向井边奔去，好像要随珍妃去一样。这下把太后和众人吓坏了，急忙说：“快把皇上抓回来！”众人忙把皇上拥上了马车。
回京之后，光绪帝想着珍妃还泡在井里，心里一阵阵发痛，他含泪想了好久，叫来太监：“给我去传，我要面见老佛爷。”此时慈禧也病了，她也总梦见珍妃，想着珍妃投井时的惨状，也觉得可悲。光绪帝一来，慈禧明白了，于是她派人去把珍妃的尸体从井里捞了出来。光绪帝强忍泪水，为珍妃守了一天的灵。晚上，珍妃入殓，棺椁由内务府派人悄悄抬出，暂葬在西直门田村墓地。
光绪帝把拟好的对珍妃的封谥给慈禧过目，慈禧只改了一个字：“上年京师之变，仓猝之中，珍妃避难不及，即于宫闱殉难，询属节烈可嘉，加恩赠贵妃，以示褒恤。特诠。”慈禧只在贵妃前加了一个“皇”字，这也足以让光绪感激涕零。
民国二年（1913）三月，珍妃冢由田村移到河北易县清西陵光绪帝墓旁。这对苦命的乱世皇家鸳鸯又在一起了。
