唐文治任校长14年，他坚持了求实、务实的办学主张，坚定了以工科为主的办学方向，逐步创建了近代高等工科教育体制。在专业设置方面，以工为主，工管结合；教学上工文并重，开创了我国高等教育的先例。他在办学中十分重视新生的入学质量，教学要求严格，注重教学与实践相结合，学以致用，成为我校良好教学传统的一个开端，并形成了爱国、俭朴、勤奋、求实的学风。唐文治既是国学大师，又努力把交大创办为一所较完备的工科大学，为学校发展成为著名的理工科大学奠定了基础。学校以“中学（中文）好、科学好、体育好”而驰名，是我国东南各省中国人自己办的最早的一所工科大学，有东南表率之称，为国家培养了一批最早的质量较高的工程技术人才。
高等教育思想
唐文治认为，要培养的人才是砥砺品德、擎天柱地，能与欧美争胜的人才，是要品学兼优的第一等人才，是要能成为领袖的人才，要能振兴中国使国家富强的人才。
培养优良学风
为培养学校内的读书风气，唐文治提出科学尚实，“求实学，办实事，学以致用”的目标。并写入校歌：“实心实力求实学，实心实力务实业”。让学生时刻不忘为将来救国创业，在当前必须认真读书的重要性。这和此前公学办学方向模糊，学生唯图虚名，人事更迭频繁，学潮起伏，学生不能安心求学的情况，有了彻底的改变。他还提出了勤、俭、敬、信的校训，并说明“勤”：吾辈生于今世，聪明不如人，智慧不如人，武力不如人，以至国势更不如人，诸生务宜昼夜为之，措之于勤学，业精于勤；“俭”：是德之本，凡人之丧其操守，失其气节，大半由于妄取膏粱，衣着奢华之故，当出而问世，安得不妄取？自是而名誉扫地，气骨无存。俭以养廉，是立品之始基。生活俭朴，放僻邪侈的行为可以杜绝；“敬”：日用行习，莫要于敬事，处事而不敬，不能成事，即不能成人。有礼者敬人，敬人者人恒敬之，敬师而后知敬学；“信”：民无信不立，有信而后能立业，言而有信。戒欺诈，无论常变，无论久暂，无论生死，必须守定信用。告诫学生要慎尔出话，慎尔然诺。
学生进校后有了目标，引导认真刻苦读书和人格培养同时并进。这就是以后被总结为爱国、俭朴、勤奋、求实的优良校风，也是造就一代又一代交大学人的首要条件。到了上世纪20年代早期，唐文治又以勤、慎、忠、信、恒要求师生。到了30年代，提倡精勤求学，敦笃励志，果毅力行，忠恕任事。这也说明了学校的教育理念是与时俱进的。
重视道德教育
志于道，据于德，人而至难得者，道德有于身而已矣。道是指多才艺，德是指能躬行。治学要在立身致用上下功夫，要为国家人民建功立业。严义利之辨，非分之财，一介不取，去一己之私利，谋国家人民之公利。要立天下之大节，办天下之大事。不为风气所转移，乃能转移风气。
道德，基础也，科学屋宇垣墉也，彼淹贯科学，当世宁无其人，如忘身徇利，一旦名誉扫地，譬如基础未筑，则屋宇垣墉，势必为风雨飘摇不能久固，如此者由于道德之不明也。人生要学会吃苦、耐劳，以锻炼其意志，增益其所不能，如常处安乐之境，私心杂念，惟追求享乐，必不能担当重任，为人民造福。交通大学礼堂曾挂有一副唐文治撰的对联：“好学近乎智，力行近乎仁，知耻近乎勇，虽愚必明，虽柔必强。富贵不能淫，贫贱不能移，威武不能屈，所存者神，所过者化”。上联是用《中庸》记载孔子的话，指出为学之道，下联是《孟子》句，重视气节，给学生以启迪。
起点高，学科紧
大部分学生由中院（即中学堂）直升，经小学、中学严格培养，学生质量相对地比社会同等学校高出许多，大中小学联办在当时开风气之先，适应当时需要。向社会招考，只能千里挑一。入校时学生程度高，入学后学科多，学生心思脑力都用在课业上。考试次数多，注重平时成绩，学生重视平时学习，勤奋踏实，养成良好的学习习惯。凡人之疏懒，多因饱暖无事，苟有必不获已之事，不得不勉力为之。故学校于功课必须严重，尤须督责自修，使无余暇，勉力既久，乃成自然；学成之后，出而工作，就能任重任劳，不畏困难。
中西学并重
工科要有些文科基础，唐文治在交大创设国文科，又成立国文研究会，组织一年一度的国文大会，每星期日上午由唐文治亲自主讲国文，十余年从未间断。文章通顺，成为交大学生特色之一。唐文治说道：“继自今者，笃信殚精，锲而不舍，……我校必有进于道德家者；总撙万变，网罗典章，我校必有进于政治家者；方墨经之旁行，象画记之刻划，我校必将有通译闳材者；研道学之奥窍，发良知之真诠，我校必将有绍述师传者；……则吾向所谓国文当兴而不当废，历千万年而不可磨灭者，意在斯乎……”。
唐文治同样也重视西文，1910年继设立国文科之后，又成立了西文科，为学生开设课外的外语补习，分英语、德语、法语和拉丁语等多种，学生可自愿参加。同时成立英文大会，规定全校学生一律为会员，每学期组织一次英文演讲会和英文辩论会，每年还有一次英文作文竞赛。还规定在英文课和用英文教授各课时，误用国语一语者都要受罚。专科生做实验报告或作业，均须以英文书写等。经过多年的训练，学校的毕业生，外文都达到了较高水平，为出国深造具备了条件，受到国外学校的欢迎。
办学自主权
凡有利于推进教学方向的事，就只争朝夕地去办，不受陈规旧制的约束，譬如1913年铁路科、电机科改名土木科和电气机械科，并开设有关管理的课程，如工业管理、工矿管理法、工业簿记等课程，不符上级设置规程，虽指令取消，但唐文治却要求实事求是，不以文法相绳。在1917年又根据需要设置了铁路管理专科，也越出当时政府公布的《实业学校规程》设科范围。学校从此开创了工管结合的办学道路。同时学制也改为四年，迈向国外正规大学。学校不断地追求改进，主动提出了各项措施，所以当时就程度而言，与国外大学相比，不但并驾齐驱，且能超越，即便在美国如果持有交通部上海工业专门学校的毕业证书，也可以和美国大学毕业生一样，享受报考美国研究院的同等待遇。
重视体育运动
中国有古训：“有文事必有武备”。交大实行“军国民教育”并不停留在口头，而是轮流去苏州打靶场进行实弹演习，当时视为新闻。凡体育场地必须布置适当，运动器械必须购备齐全。1907年起本校运动项目逐年增加，除体育课外，有田径、足球、篮球、网球、棒球、越野赛跑、游泳等项，而尤具特色的国术（技击），聘名师教授，参加人数曾达全校之半，足球屡挫强队，知名国内。为增强学生体质，1915年起开展强迫运动，要求学生在课外活动时间，必须参加指定三项活动（技击、童子军和乐队，后两项对象为附中和小学）之一项，做到普及与提高并举。对校队运动员，唐文治亲自关心其饮食营养，给予照顾；遇足球重要赛事，唐文治亲临观战，以鼓舞士气。抓课业同时抓好体育，成为交大的又一特色。
不断完善实习和试验设备
1908年后陆续建成铁道测量仪器室、金工厂、电机实验室、木工厂和材料实验室，扩建了物理、化学试验室等。所有设备都是苦心筹划，撙节费用，争取上级支持，才得稍具规模。尤为突出的是募款建造图书馆，唐文治上至当时大总统黎元洪、国务总理段祺瑞都吁请支持。在当时艰难条件下，终于建成，为学校提供了良好学习条件。
不论室内实验或野外实习，事先要订出计划，事后要写出总结，还要经过认真的评阅，贯穿实学实事精神。凡集会养成办事之才干，学校于运动会、演讲会、学术研究会、游艺会等，唐文治极力提倡，俾任事之人，得以习条理，练交际，同会之人，通力合作，皆有锻炼之机会，异日效用社会，不致乏应付联络之资。
完善规章制度
严订章程，以道德端其模范，以规章束其身心，庶几教授管理有可措手，学生乃能有志上进，蔚为通材。培养之道宜加意者，如植佳木，……慎勿伤之，渥加灌溉，有旁出者稍稍剪裁，而大木乃奋迅凌霄而不可遏。是以所拟章程，大抵以“功课密、管理严”六字为主。学生在校衣食，衣有定制，不得自便；食有定额，不得过分。然后养成清俭自守，终必为社会所信任。
尊师爱生
凡学之道，严师为难，师严然后道尊。为师者亦当知自尊之道。为师者须明教法，善歌者使人继其声，善教者使人继其志。教授管理，皆重在心理，善教法者能深知学生心理，俾之听受。君子之教，贵在养其自治之能力和自治之精神，则学者皆有心得，较之外袭而取，稍久即忘者，不可同日而语。为师者对于学生，朝夕相见，礼仪无失，于其疾病缓急，加以调护扶持，问疑质难，晨昏无间，学生自能感化于无形，乃可以承传其学术。
以身作则
师惟自果其行，而后能教人。惟自育其德，而后能育人。凡浮夸无实者，以之教人，其败立见。师道之本，但求实际，不务高论。前人有言，以言教者讼，以身教者从。为师者时时处处以身作则。凡施教他人之子弟，亦犹己之子弟，宜常思受人委托之重，有善则劝勉之，有过则督责之，或用直言，或用婉道，或用刚克，或用柔克，务令进于道义之途。至于疾病则宜维持之，调护之，不可稍有怠忽，稍有隔膜。当思己之爱怜子弟如何，他人爱怜子弟亦复如此。学生在膳堂用餐，自己也和学生同桌就餐。学生在校应穿校服，自己也穿校服，这就是平等。孟子述伊尹之言曰：“天之生此民也，使先知觉后知，使先觉觉后觉也。予天民之先觉者也，予将以斯道觉斯民也，非予觉之而谁也。”唐文治即以此旨教育学生，亦即挺然自任救国育才重任。
唐文治办学，克服重重困难，坚忍不拔，可于以下一段文字中得到说明：学校“飘摇风雨，屡濒于危，经济困迫，彼时今日不知明日，本月不知下月，本学期不知下学期，自接办本校以后，中央议裁小学者三次，议裁中学者二次，议归并土木科者一次，议裁电机科者一次，每当议裁议并之时，每念及诸生被裁后往何处读书，各父兄家属更不知若何忧虑，对于诸生未便宣布，而笔舌力争，案头积牍盈寸。……追溯从前，以功课而言，则一日未尝停课，以工厂机械而言，则屡有扩充，以学生数额而言，则历年累有增加，费如许心血；历无限艰辛，乃得稍稍有此成绩……”。
除上述以外，还要求学生奉行的有：
“立诚学生在校修业，以立诚始，诚的反义词是虚伪，求学和造就人格，不能有半点虚伪，所以最重诚。诚之者，择善而固执之者也，博学之，审问之，慎思之，明辨之，笃行之。经过以上学习之后，仍有未明了的地方，就要继续深入，决不停止。要做到人一能之，己百之，人十能之，己千之。以这样至诚的态度去对待学习，就虽愚必明，虽柔必强。”
“尚志学者立志必须为天下第一等人，以第一等人自命，且不免为第二第三等人。人而无志，不可为人，立志而误，亦不能以成人。故所谓第一等人者，非狂妄之谓，要在归诸实践。孟子曰：‘彼丈夫也，我丈夫也，有为者，亦若是。’望我学生振起精神，将来以救国救民有益于国家社会自任。”
“有恒必须有恒久之志气，而后有恒久之精神。于学问其始也，当勇往而精进，其继也当优游而涵泳，其终也当贞固而不懈。有恒之精神，半生于历练，半生于生理，身体不健，精神萎靡，不能持久，故应讲求卫生，则有恒之基立。此项在20世纪30年代，交大已列入校训。大凡工业之创新发明，有恒最为重要。”
“知耻知耻近乎勇，惟知耻而后能愧奋，愧奋而后能自强。凡人心思惟务取巧，必至于阴险欺诈，穿窬害人而后已。譬之在考试之时，或怀挟抄袭，倩人捉刀，或请求师长，多给分数，甚者钻谋无所不至，岂非可耻之尤。一旦身入社会，身入政界，其卑鄙龌龊，恐将十百倍于今日者。因之败坏全校名誉，败坏全国名誉。《论语》：‘行已有耻，博学于文。’不知耻大抵心为利诱，要严义利之辨，非其份者，一介不取，才可转移天下风气，而不为风气所转移。”
“取友独学而寡友，则孤陋而寡闻，取友也是成才之要道。人之气质，或偏于厚，或偏于薄，或偏于清，或偏于浊，所以变化之者，惟有读书、取友两端而已。读书而正，取友而端，则其为君子可知也。读邪僻之书，取游荡之友，则其为下流之归可知也。盖交良友，口不为无益之言，身不为无益之事，心不为无益之思，其精进也，如绝尘而奔矣。”
“又交大校友团结精神非常坚强，遍布海内外的南洋校友会，遇事互相帮助，遇难互相支援，工作通力合作，这许多优良品质，可说都是在校时相互淬砺中得来，自校长不断教导的取人为善，与人为善感化中得来。”
“公德近世学生，罔知公德。于己物则爱之宝之，于公家之物，则毁之弃之。学校如此，进入社会亦如此。推是以往，于是公事则任意废弛，公物则任意蹂躏，公产则任意侵割，但有私心。所以学生任意毁弃器物而不加禁止，是养成其自私不良品质，贻福自身，亦影响及社会。因此反复叮咛，学生应注意公德。”
“勤俭民生在勤，勤则不匮。勤能补绌。光明稍纵即逝，故学生宜勿怠勿荒，及时勤勉。”
“养德必须崇俭，及近时学生于彰身之富，饮食之精，居室之美，皆欲仿西方之奢侈。举父兄之血资而尽丧失之，甚或求贷于人，人格堕落。为此学生务必勤俭茹苦，身亲工作之要务。否则一遇劳苦之境，必一步不能行，一事不能办。古人云：由俭入奢易，由奢入俭难。一开其端，则涓涓不息，遂至无所底止。所从俭者可以寡嗜欲而养心性，故不惮反复言之。”
