日本陆军大将特高课土肥原一郎领导两名物理学家和一名生物学家，在伪满国远山深处建立了一个秘密部队“九日研究所”，用来进行“合体人”研究试验，实验品则是当时的中国战俘。
就在试验秘密进行之时，远山战俘营突然发生中国战俘越狱逃亡事件。以雷子为首的八名战俘成功逃出日军战俘营，进入了战俘营旁远山中的原始森林。战俘们怀着喜悦和对未知前途的忐忑，在森林中不断深入，可迎接他们的却是一系列诡异的遭遇：没有活物的环境；异常漫长的白昼与黑夜；沉满腐尸的水潭；潜伏在身边的吸血怪物；以及一个不应该出现在原始森林中，却又确实存在的神秘机构……
战俘营伪军军官邵德带领几个日军士官和一个排的伪军紧随其后进入这片森林，所遭遇到的各种奇怪现象也接踵而来：士兵接二连三地离奇死亡并凭空消失；神出鬼没食人肉的鬼娃娃……更为骇人的发现是——上千个战俘被浸泡在玻璃容器里！
在追捕过程中，邵德发现整个战俘逃亡事件与三年前同样发生在战俘营的另一起事件竟惊人的雷同！并近乎绝望地察觉到自己和这一切有着千丝万缕的联系。甚至自己与正被追捕的战俘雷子，和三年前同样逃出战俘营的战俘曹正等人正在慢慢重合……看似平静的丛林深处，延安，军统，中统，甚至苏联红军各方面势力围绕“九日研究所”慢慢浮出水面，真相究竟能否大白于天下？
