重庆市有佛教、道教、伊斯兰教、天主教和基督教。宗教信徒100余万人，开放宗教活动场所215处。广大信教群众和宗教界人士高举爱国爱教的旗帜，拥护党和政府的领导，为经济建设和社会主义精神文明建设作出了贡献。
佛教于东汉末期传入重庆。现有罗汉寺、慈云寺、双桂堂、华岩寺等全国重点寺庙。大足石刻载着千年佛教文化，被列为世界文化遗产。重庆市佛教协会近年创办了佛教界希望工程和慈善功德会，开展救助失学儿童和贫困母亲活动，受到社会各界好评。
道教于东汉末年传入重庆。南岸黄角垭老君洞，现为道教全真龙门派丛林道观。万州太白岩有晋代道教遗迹“绝尘龛”，亦为唐代诗人李太白访道之处。隋朝时潼南大佛附近的定明山石刻道教人物造像，是重庆区域道教最早的道教魔岩石刻文化。此外綦江白云观、奉节天仙观等，都是闻名遐迩的重要道观。
伊斯兰教在元代传入重庆。元末奉节已建清真寺。全市现有穆斯林总数1万余人，阿訇10人，清真寺8座。渝中区中兴路穆斯林大厦为重庆市伊斯兰教协会驻地，阿拉伯式建筑风格的清真寺礼拜大殿位于大厦顶层，大厦内还设有客房和清真餐厅，是重庆市接待国内外穆斯林的重要场所。
天主教于清康熙四十一年（1702年）传入重庆，1856年成立川东南代牧区（即重庆教区）。1930年从重庆教区划分出万县教区。现有信徒约20万人，教堂及宗教活动点57处，神职人员25人，修女19人。主要宗教团体有重庆市天主教爱国会、重庆市天主教教务委员会等。渝中区若瑟堂为重庆教区主教座堂和市两会所在地。
基督教实行联合礼拜，信徒27万人，开放礼拜堂、福音堂50多座，聚会点400多个，有牧师28人，传道员21人。部分教会还兴办了招待所、幼儿园、诊所及其他社会服务项目。主要宗教团体有重庆市基督教三自爱国运动委员会、重庆市基督教协会。重要场所有社交会堂（正在城市片区改造迁建过程中）、解放西路礼拜堂、江北区福音堂等。
