在各种运输方式中，如何选择适当的运输方式是物流合理化的重要问题。一般来讲，应从物流系统要求的服务水平和允许的物流成本来决定，可以使用一种运输方式也可以使用联运方式。决定运输方式，可以在考虑具体条件的基础上，对下述五个具体项目认真研究考虑：（1）货物品种。关于货物品种、性质及形状，应在包装项目中加以说明，选择适合这些货物特性和形状的运输方式，货物对运费的负担能力也要认真考虑。
（2）运输期限。运输期限必须与交货日期相联系，应保证运输时限。必须调查各种运输工具所需要的运输时间，根据运输时间来选择运输工具。运输时间的快慢顺序一般情况下依次为：航空运输、汽车运输、铁路运输、船舶运输。各运输工具可以按照它的速度编组来安排日程，加上它的两端及中转的作业时间，就可以算出所需的运输时间。在商品流通中，研究这些运输方式的现状，进行有计划的运输，确保有一个准确的交货日期是基本的要求。
（3）运输成本。运输成本因货物的种类、重量、容积、运距不同而不同。而且，运输工具不同，运输成本也会发生变化。在考虑运输成本时，必须注意运费与其他物流子系统之间存在着互为利弊的关系，不能只考虑运输费用来决定运输方式，要由全部总成本来决定。
（4）运输距离。从运输距离看，一般情况下可以依照以下原则：300千米以内，用汽车运输；300～500千米，用铁路运输；500千米以上，用船舶运输。一般采取这样的选择是比较经济合理的。
（5）运输批量。再看一下运输批量的影响，因为大批量运输成本低，应尽可能使商品集中到最终消费者附近，选择合适的运输工具进行运输是降低成本的良策。一般来说，15～20吨以下的商品用汽车运输；15～20吨以上的商品用铁路运输；数百吨以上的原材料之类的商品，应选择船舶运输。
