在王码五笔字型汉字录入法中，“重码”就是指几个五笔字型编码完全相同的字。迄今为止，重码是任何一种常用汉字录入编码方案都不能完全避免的问题，王码五笔字型汉字录入方案也同样不能回避这一需要讨论的问题。虽然在王码五笔字型中已经通过调整各种方法试图把重码率降到最低，但是重码现象仍然不能避免。
如果希望一种汉字输入法简单易学，并且能够保证汉字的高速录入，就需要尽可能简化编码规则，缩短每个汉字的平均录入码长。与此同时，汉字编码内就会不可避免地减少有效信息，使重码问题浮出水面。由此可见，保证高效的汉字录入与重码的避免是相互矛盾的。
由于五笔适合使用者盲打，操作人员几乎不用看键盘和显示器，因此在大多数的五笔录入软件中，当出现了需要进行选择的重码时，就会自动发出报警声响，提示对重码进行选择。通常情况下，使用频率最高的汉字或词汇排在“1”号，因此如果需要选择的对象刚好在第“1”的位置上，就可以按下空格键选取，也可以直接继续录入下面的文字，这时“1”号汉字或词汇会被默认选取。如果所需要的字排在“2”号或“2”号之后，选取过程可以通过按下相应的数字键来完成。由于在王码五笔中的重码率低于万分之二，因此这种需要选择才能确定输入的情况只是极个别的现象，不会影响汉字的正常录入。
例如，“去”、“支”和“云”三个字是重码，当键入FCU时，提示出现重码。因为在这三个字中，“去”是高频字，所以被放置在第一位。这时如果需要选择“去”字，可以直接按下空格键，或根本不去理会这个提示窗口，继续下面的录入操作，“去”字就会自然而然地被录入了。如果需要选择“支”字，可以单击键盘上的数字键“2”，如果需要选择“云”字，可以单击键盘上的数字键“3”。
