先岛群岛虽然离台湾的海路不足一百里，但却是属于琉球群岛的最边缘地带。而这时的琉球王国早己经沦为曰本萨摩藩的傀儡政权，因此商家军在石桓岛和西表岛建立了海军基地的消息，也很快就传到了萨摩藩所在的日本鹿儿岛。
这个时候萨摩藩在曰本战国末期的几位风云人物岛津胜久、岛津贵久、岛津义久、岛津义弘、岛津忠桓等人都己作古，现任的藩主是岛津忠桓的次男岛津光久，现年三十岁，是在三年前继任萨摩藩大名。
现在琉球王国是萨摩藩财政收入的主要来源。萨摩藩也视琉球群岛为自己的私人禁地，不许他人插手，那怕是边缘地区，也不例外。因此岛津光久得知明军在石桓岛和西表岛上建立海军基地之后，也大吃一惊。第一反应就是这一定和郑芝龙有关，因为在岛津光久的映像中，明朝只有郑芝龙有船队在海上活动。
萨摩藩和郑芝龙到还有一些生意来往，因此岛津光久在立刻派出弟弟岛津忠朗为使者，前进西表岛，向驻守那里的明军提出交涉，并要求明军立刻撤离先岛群岛地区。
那知岛津忠朗到了西表岛之后，发现驻守在这里的其实是西班牙军，也不禁大为震惊，因为他们只带了中文通译，而西表岛也没有日语翻译，只有两个会一些中文的传教士，结果双方沟通十分麻烦，必须先译成中文，再分别译成西班牙语和曰语，但日本的翻译和传教士对中文的理解上，又有很大的差别，结果说了半天，双方都没有完全弄明白对方的话。
只是有几件事件，岛津忠朗总算是弄清楚了，占领西表岛的明军与郑芝龙并无关系，这支西班牙军是受雇于一个叫商毅的明朝候爵的私军，但岛津忠朗也不知道这个商毅是何许人也。而西班牙军的主将莫亚的理解是，对方也想占领西表岛，但晚了一步，因此要求自己离开，好把这个岛让给他们。这下双方当然谈不好，莫亚的态度越来越强硬，而岛津忠朗则认为对方是蛮不讲理，结果自然是不欢而散。
岛津忠朗回到琉球之后，仔细一打听才知道，这个商毅是海上的一股新兴势力，好像和荷兰人打过一仗，还占领了台湾。等他回去向岛津光久报告之后，岛津光久也百思不得其解，有心派人到明朝去面见明朝的皇帝，但一来太耗时间，也不知那里去找门路，岛津光久毕竟也是一藩之主，当然知道那一个国家的官场这趟水不好走，商毅既然敢公然侵占先岛诸岛，一定是有所倚仗，就是找到明朝的皇帝，也未必能让明军撤离，当然萨摩藩以武力胁迫控制琉球王国的事实，则被岛津光久直接无视掉了。
因此岛津光久最终还是决定，还是用武力来解决。以这近百年来明朝的态度看，对海外并不感兴趣，马尼拉的华人被大屠杀后，明朝没有理，而萨摩藩侵占琉球王国之后明朝也没有理。因此这次自己用武力夺回西表岛和石恒岛，估计明朝还是不会理。
不过现在的萨摩藩可不是当初关原之战时的曰本强藩，封地被徳川幕府削减了大半，精兵强将也损失大半，而且又缺乏水军的力晕，岛津光久又下令征集船只，组织军队，结果花了几个月的时间，才总算是征集齐了六十余艘大小船只，军队六千余人，由岛津忠朗出任主将、并率领伊势贞行、平田宗兴、桦山久平等家臣大将，收复西表岛和石垣岛。
不过在这几个月的筹备时间，岛津光久也打听到一些先岛明军的情况，他们的总兵力约为两千左右，还要分守两个岛，而战船也不足二十艘，因此以自己这样的兵力，夺回这两个岛还是绰绰有余的。而岛津忠朗也是信心十足，带领着船队出发。
萨摩船队首先停靠琉球，以琉球王朝的都城首里为后方基地，然后刀向先岛诸岛进攻过来。而岛津忠朗派家臣桦山久平为先，率领三十艘战船，攻领先岛诸岛东北的宫古岛，为前方基地。
桦山久平是萨摩藩的名将桦山久义之后，而桦山久义正是帮助萨摩藩控制琉球的主要功臣，桦山久平也很以自己先祖为豪，只是他出生之后，曰本己统一在德川幕府的旗下，萨摩藩也无力与德川将军相抗争，因此只有老老实实做了顺民，承平日久，武士也无建功立业的机会。因此桦山久平也己经感叹自己晚生了几十年，没有赶上那个叱咤风云的大时代。
而现在总算是有了出战的机会，因此桦山久平也兴奋异常，决心在这次战斗中一定要立下武勋，也为桦山家增加荣耀。因此在攻占了平良岛之后，桦山久平也不顾主将还没有赶到，就留下少数兵力守卫平良岛，自己带领着大队船队，向石垣、西表两岛进攻过来。
萨摩船队到平良岛之后，立刻被西表、石垣二岛上的西班牙军发现，两名西班牙军官莫亚和阿尔维斯经过商议之后，决定率领船队主动出击，先给萨摩船队一个迎头痛击，同时也派人向浙江报急，也派人到台湾，请驻守台湾的沈寿岳派兵来支援。
正好这时桦山久平也率领着舰队向石垣岛进发，双方在先岛诸岛中部的水纳岛海域遭遇，展开激战。
在这一战中，西班牙雇佣舰队一同投入十五艘战船，都是中小型战舰，最大的是八百吨的皇家园林巡游者号，另外还有四艘七百吨战舰、六艘六百吨战舰，四艘五百吨战舰。而萨摩船队出动了二十六艘战船，不过这时日本的造船技术十分落后，最大的一艘也不超过五百吨，还有八艘两百吨以下的小船。结果一方船少但体大，而另一方小则多，算成总吨，还大致相当。
但一打起来可就满不是那么回事了，因为曰本的海战理念依然停留在当初的丰臣秀吉侵朝战争时代，仍然是以靠近用火箭射，然后接舷跳帮战为主要战术，萨摩船队的船小不说，而且配有火炮的战船竟还不足十艘，而且最多的一艘战船上装配的火炮只有八门，还都是小炮。而西班牙雇佣舰队随便拉出一条船的火炮都要超过它们一倍，而旗舰皇家园林巡游者号，一共装配了七十门火炮，一下子就要把萨摩船队比化了。
结果一战下来，萨摩船队被打得大败，被击沉六艘，俘虏二艘，拆兵六百余人。桦山久平带领着败军逃回平良岛去了。而西班牙雇佣舰队仅仅只被烧毁一条船，受伤两艘，损失了三十四名士兵。
不过尽管西班牙雇佣舰队在第一战取得大胜，但萨摩船队的后队赶到了平良岛之后，战船总数超六十艘，虽然船小炮少，但也是蚁多咬死象，莫亚和阿尔维斯也不敢轻易向宫古岛发动进攻，因此把战船集中在西表岛和石垣岛之间，两面支持，而同时驻守台湾的沈寿岳也拔来了一千士兵，六艘船，帮助守岛。只等浙江派来援军。
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商毅现在当然还不知道双方水战的结果，不过对这次中日之间的冲突可以不敢马虎，他对日本本来就没什么好感，只不过是现在腾不出手来收拾他们，何况这一回小日本居然主动惹到自己头上来了，那自然也就不会客气。
而且商毅也十分清楚，这个时代的日本颇有些向一百年后的中国，闭关自守，承久太平，战国时代的尚武精神和血气之勇己被太平时光消摩得差不多了，而武士道疯狂精神还要等到二百多年以后，才会出现，因此也可以说，现在的日本正是国力隆盛，但武力松驰的时候。
商毅当然不会对日本讲什么费尓沷赖精神，相反越是落水狗，就越是要痛打。而且自从商家军走向海洋之后，向南的目标就是马尼拉，而向北的目标就是琉球，这是这两处地方，正是东亚及东南亚海域的南北要路，占领西表岛和石垣岛只是第一步，商毅正愁沒机会对琉球下手，想不到曰本人主动把机会送上门来了，这可是上门的买卖不得不做啊。虽然现在以自己的力量，攻打马尼拉还颇有不足，但对琉球动手，还是足够的。
因此就在很短的时间里，商毅就做出决定，一次不仅仅是要把萨摩藩痛打一顿，让他们知道疼为止，而且一定把自己的海上势力插入到琉球群岛内部。同时也是对整个曰本的一次搞山震虎，看一看徳川幕府会有什么反应。
于是商毅也立刻决定，取消今天下午视查兵工厂的行程，招集海军将领开会，商讨这次这次对曰本萨摩藩的战斗安排布置计划。也命成进和黄震马上去通知安排，让海军将领明天上午都赶到督师衙门来开会。
成进和黄震离开了督师衙门以后，商毅忽然想到在杭州还住着一个充满了疑点的日本商团，而且这个日本商团就是来自萨摩藩，那么这次的战争和他们会不会有什么关糸呢？因此商毅也立刻下令，让人把安全处的付责人周奇找来，问一问曰本商团的情况。
