1994年4月，拉登被沙特取消了国籍。这让拉登最终孤注一掷，凭着其家族在建筑业中所积累下来的数十亿美元的家财，开始了他的活动。只要哪一地区的穆斯林陷入困境，他就会帮着招兵买马，甚至带兵征战。由于中央情报局所代表的美国屡屡想在穆斯林世界站稳脚跟，这俨然与拉登“统一”穆斯林世界的愿望背道而驰，所以，拉登最终把打击目标专注地放在了美国人身上。
早在1996年1月，中央情报局就成立了一个由12人组成的反恐小组，全力对付拉登在苏丹的工作站。该部门的主要任务是了解“本·拉登在哪里？他的巢穴在哪里？支持他的后勤管道和途径在哪里？他们是怎么相互联系的？他的支持者和盟友是谁？谁在赞助他们？”该部门的代号是“Alec”，“拉登处”是它通俗的叫法。几年后，这个部门的人数可能翻了至少几十倍。中央情报局的这个小组刚成立，就隐约觉得拉登会向美国的海外目标发动攻击，因为他们有可靠情报，拉登正大力资助北非的恐怖组织，于是，中央情报局通过政府向苏丹政府施压，迫使他们驱逐拉登。拉登被迫于该年的5月份辗转返回到他的成名地阿富汗。在阿富汗巩固了他的基地后，很快就让他庞大的国际网络投入工作。
1997年，拉登频频向美国发出威胁，并且声称“有组织地杀死美国人和他们的同盟军，这是每一个任何国籍的穆斯林的个人义务。”1998年2月，拉登突然宣布，他是奉真主之命执行杀美国人的任务的。他的这份声明让中央情报局大为震动，中央情报局巴勒斯坦工作站站长施罗恩制定了一个计划，打算趁拉登到阿富汗南部大城坎大哈时将其绑架。这一计划立即得到中央情报局局长特尼特的赞同，要求“拉登处”协同特别行动小组执行计划。后在6月初，特尼特局长又突然取消了这一计划。
直至2001年9月11日，“9·11”事件发生。
据美国中央情报局调查报告，在“9·11”事件发生后，基地组织主要在阿富汗、中亚、中东地区活动。其最高领导是以拉登为首的中央委员会，下设有4个专门职能委员会，分别负责管理军事、宗教、宣传和财务事务。基地组织在阿拉伯有10多处训练基地，对从各国来到阿富汗的成员进行恐怖活动训练。训练内容包括学习原教旨主义教义，学习使用轻型武器、使用电脑。
其实，早在上个世纪80年代反抗苏军侵占阿富汗的时候，前往阿富汗作战的宗教极端分子们就已经熟知“基地”这个词的具体含义了。拉登的精神导师阿卜杜拉·阿扎姆早在1987年的时候就写道：“每一条宗教原则都得有人去维护，每个人都应该扛起重任和作出牺牲，这就是我们的根本！”
据估计，自上世纪末以来，在“基地”接受过训练的人有3万以上，他们被称为“阿富汗的阿拉伯人”。据悉，“基地”组织核心成员约400-5000人，主要由“阿富汗的阿拉伯人”组成。拉登通过传真、移动电话、因特网或信使遥控指挥其在世界各地的支持者。
“基地”组织三层核心鲜为人知，边缘团体跑到“基地”训练营偷艺被逐。到1999年和2000年的样子，“基地”组织才真正地成熟起来。不过，就算“基地”组织成熟的时候，其核心机构其实也没有多大，甚至于外界动不动就指某个组织是“基地”，那是不了解基地组织的真正结构情况。
“基地”组织三层核心：
第一层核心是“基地硬骨头”，这个核心是由拉登本人以及那些自八十年代以来一直随拉登鞍前马后跑的人组成，人数在数十人左右。当然了，后来也有一些有经验的人被吸纳入这层核心，比如说曾在菲律宾和其他地方屡屡制造炸弹爆炸事件的哈立德·穆罕默德。
第二层核心是数十个分散在世界各地的“基地”组织分支的领袖人物。这些组织分支往往原本就是当地极端组织，它们通过各种关系与拉登搭上线，并且得到拉登的完全赏识、信任和训练之后，才能进入“基地”圈子。
第三层核心是拉登最铁杆的秘密信徒。这些人并不从事恐怖行动，而是分散在世界各地，有着正当的职业和道德操守，但他们却秘密为拉登搜集情报和筹集资金！这个核心拉登非常看重。
3.塔利班——游击队“圣战”
2010年末，“维基解密”创始人阿桑奇在接受阿拉伯半岛电视台采访时指出，大量在阿拉伯国家担任要职的高官与美国情报局CIA有密切的接触，他们经常访问美国在这些国家的使馆。阿桑奇说，“这些重要官员是美国在这些国家的间谍”。
据“维基解密”《阿富汗战争日志》中的文件披露，美军与塔利班的交火中，美军往往杀错人，导致平民死亡，引发阿富汗人的憎恨。美军越来越多地使用无人机侦测和打击阿富汗的目标，但经常发生坠机情况。令人惊讶的是，文件显示，塔利班当下已拥有具热寻功能的便携式地对空导弹，而过去美军从未公开承认塔利班有如此装备。
阿富汗虽然只有约2993万人口（2007年1月），却有20多个民族，数百年来，因为民族、宗教的世代恩怨，部落之间相互争斗不断。阿富汗有三个较大的民族，普什图族有人口1100万，约占阿富汗总人口的40％。普什图人对国家断断续续统治了两个世纪。被推翻的国王查希尔、塔利班领袖奥马尔、前总理希克马蒂亚尔都是普什图人。普什图人长期得到巴基斯坦的政治和军事支持。绝大多数普什图人是穆斯林逊尼派。普什图人主要居住在兴都库什山以南。在阿富汗北部，普什图人不到15％。
塔吉克族有人口500万，占全国人口25％。塔吉克人属穆斯林逊尼派，是阿富汗历史上人才辈出的民族，在国家中有很强的影响力。大多数部长、银行家和大商人都来自这个民族。大多数喀布尔人也是塔吉克人。如果不把拉巴尼短暂的执政算进去的话，塔吉克人总共统治过阿富汗两次——14世纪、20世纪20年代末。塔吉克人是北方联盟的骨干。已故的马苏德将军、拉巴尼总统、法希姆将军、伊斯梅尔汗将军都是塔吉克人。
乌兹别克族有人口230万。乌兹别克人相当稠密地居住在靠近独联体的省份。阿富汗的乌兹别克人是穆斯林逊尼派。
阿富汗由于地形复杂，交通不便，经济落后，各部族间相互隔绝。部族的内部事务由各自的首领管理，而且大多数部族拥有自己的武装组织，矛盾错综复杂。
普什图族是阿最大的民族。在过去的200多年里，普什图族在阿军事、政治和经济生活中占统治地位。普什图族与非普什图族之间常常处于相互对立的状态。
塔利班是阿富汗武装派别之一。“塔利班”在阿富汗普什图语中是“宗教学生”的意思，也称“学生军”。其骨干成员多来自宗教学校或受过培训的阿富汗普什图族难民。塔利班属伊斯兰教逊尼派，信奉原教旨主义，致力于建立“世界上最纯粹的伊斯兰国家”。
1995年5月与6月间，塔利班在阿富汗内战不停、军阀割据的背景下发起，发动了代号为“进军喀布尔”的战役，很快的控制了阿富汗近40％的地区。并赢得阿富汗人、特别是普什图族人（占国内总人口40％）的拥护。塔利班乘胜向喀布尔发起全面攻击。同一年的9月26日，塔利班占领了电台、电视台与总统府。此时，塔利班已经全面控制了首都，之后并控制了包括首都喀布尔在内的全国90％以上的领土，而反塔利班联盟中唯一具有与塔利班正面对抗能力的，只剩下马苏德一派。
掌权后的塔利班声称要建立世界上最纯洁的伊斯兰国家，但执政以来对国家重建并无明显建树，主要在于经济每况愈下，加上疾病流行，使它得到的支持度逐渐下降。
在塔利班占领阿富汗首都五年的时间里，塔利班已经给这个曾经在20多年前饱经内战与苏联入侵洗劫的国家烙上了“不妥协的伊斯兰运动”的标记。在阿富汗，小偷会按照伊斯兰教律例处罚；妇女被禁止从事大多数职业，而且会因为通奸行为被处死；流行音乐与跳舞也已经和电视或录像一样，归入了被禁之列。即便是放风筝以及在公众场合谈笑也遭到谴责。最近，塔利班又再一次激怒了世界各地的印度教徒，因为塔利班要求在阿富汗占人口少数的印度教徒必须在外衣上佩戴特别的身份标记，以把他们与穆斯林区分开来。
2001年“9·11”事件后，在美军事打击下，塔利班政权垮台，一些残余转入山区。此后其长期隐藏于山区中，从2006年开始塔利班东山再起，并从北约手中夺回阿富汗南部地区。
当前，阿富汗“塔利班”组织虽已没有当年主政阿富汗时的实力与气魄，却也早已不是昔日败走麦城的草寇。在阿富汗，它现控制了70%的国土；在巴基斯坦，其塔利班成了比阿富汗塔利班还危险的组织；甚至在印度和斯里兰卡也出现了自称塔利班的组织。
美国军方现在已经意识到，摆在面前的麻烦数这里最大。
据“维基解密”中美国国务院的机密文件，在巴基斯坦已发现有43个恐怖分子营地，其中22个位于巴基斯坦控制的克什米尔地区。
1997年，巴基斯坦是世界上第一个承认塔利班政权的国家。“9·11”事件之后，巴基斯坦又曾是世界上唯一没有和塔利班断交的国家。后来，在美国政府的强大压力下，巴基斯坦不得不与宣布支持本·拉登的塔利班中断联系。而在追随美国反恐8年后，塔利班成了巴政府的大仇人。当年支持塔利班给巴基斯坦带来的副作用也是巨大的，它加剧了巴基斯坦逊尼派与什叶派之间的矛盾，甚至因此损害到了巴基斯坦和伊朗的关系；与阿富汗问题长期纠缠不清，还令腐败、枪支泛滥、恐怖事件如影随形，使巴基斯坦变得混乱而脆弱。近来巴基斯坦塔利班武装的频频得手更令西方担心巴将日益“塔利班化”。
自从美国推翻阿富汗塔利班政权后，塔利班就开始越过边界向巴基斯坦渗透，并在巴西北部部落地区拥有了相当的势力。斯瓦特山谷地带就是巴塔利班最牢固的控制区域之一。不过，巴军方并不承认那里是塔利班的“国中之国”，认为这是“夸大其词”，故意渲染巴军方与塔利班之间的“暧昧关系”。目前，巴塔利班控制着西北边境省联邦直辖部落区、省直辖部落区的一部分和半部落区的一部分，总计占有4万平方公里土地和约500万人口。巴政府每年都要对塔利班发动冬季攻势，但收效甚微。巴境内的塔利班还分成许多派别。实力最大的是马哈苏德领导的“巴基斯坦塔利班运动”，控制着北瓦济里斯坦和南瓦济里斯坦的绝大部分地区以及阿富汗边境的其他部族地区，成员不下1万人。该派别是唯一得到“基地”全天候资助的巴塔利班力量。
与阿富汗接壤的边境城市白沙瓦近两年来也是恐怖袭击频发之地，塔利班在这里形成了广泛而深厚的势力网。他们修建地下军事通道，训练武装分子，并通过地下通道与其他伊斯兰极端组织秘密联系。巴军方将整个白沙瓦地区称为“一个辐射巴阿边境地区弧形军事区域的支撑点”。一些在白沙瓦地区采访过的外国记者普遍表示，塔利班依托多山的复杂地形建立起了非同一般的“军事防御体系”，很难实施有效打击。
