在雍正的三个兄长之中，他觉得三阿哥允祉，最难相处，对他的威胁也最大。
三阿哥允祉是个博览群书的博学之士，为人也极厚道安静，一直颇受康熙赏识。由于允祉的博学多才，使康熙非常喜欢接近三阿哥，每每有时间，康熙都愿意去三阿哥的府上，和他畅谈诗书。
在未即位之前，胤禛也曾主动与允祉亲近，但不知道为什么，允祉出于一种莫名的心态，总是婉言谢绝对方发出的到花园赏花的邀请。
允裎、允礽对雍正来说尚构不成威胁，那么，在诸位兄长中，就只有三皇兄允祉是雍正潜在的假想敌了。鉴于二人从前争储时暗中较劲的宿怨，雍正一直很提防允祉。
三阿哥允祉受到打击比别的兄弟还要快一些。这是因为允祉较少结交外臣，他的团伙就是蒙养斋修书处那一干人，拔除既容易，也不致激起突变。雍正即位不到一个月，就开始对蒙养斋动手。
胤禛当上了皇帝之后允祉是什么态度呢?那日当隆科多代宣遗诏后，允祉带头向新君叩首，并且劝其节哀。允祉是个聪明人，看大势已去，并没有将不满的情绪挂在脸上。可是，有一次允祉后来说话走了嘴，竟然主动向雍正汇报，说当日皇上让他管理内事时，他私自出外，与管理丧期外事的允禩密语多时。雍正一向是个不露声色的人，当时没有问出他二人到底密商何事。但是，不久允禩就保荐允祉可以大用，这使雍正心中很是不快。雍正是个聪明人，从这件事情他就知道了，允祉、允禩两个人在新形势下，可能一拍即合，已经形成了一个集团。他想，对他威胁很大的允禩定是想笼络允祉，两人合谋扰乱国政。
我们可以想象得出，允祉对比他小一岁的雍正是不服的。雍正岂能就这么放过他。允祉很快被打发到景陵，守护皇父陵寝，过了很长时间才被放回来，但没有具体差事可做。
随后，雍正又杀鸡儆猴，雍正元年正月，将纂修《古今图书集成》的陈梦雷流放到东北，陈氏已七十三岁高龄，携家迁往东北及其寒冷的边疆，煞是凄惨。陈梦雷可以说是允祉的老师，也是他最得力的助手，惩治陈梦雷，对允祉集团是一个警告，让其他学士都基于恐惧，疏远了允祉。允祉被孤立起来以后，除了修书，便再也不可能有任何作为。后来，雍正另外派人主持纂修《古今图书集成》，而允祉为了此书耗费了十余年心血，到头来，却有始无终，甚是苦闷。雍正的做法差点就断送了允祉、陈梦雷用心血编纂的这部现存最大的一部古代类书。
雍正二年十一月，雍正又下令以屡次犯错、今又讹诈别人银两为罪名革去了允祉儿子弘晟的世子爵位，降为闲散宗室，交给他的父亲严加管束。说到底，降罪弘晟，还是“杀鸡给猴看”，目的是刺激允祉。
雍正六年(1728年)六月，雍正终于向允祉直接问罪了。罪名是允祉曾勒索原山西巡抚苏克济。而实际上，苏克济的案子早在六年前就结案了。可见，雍正这一回实属故意找茬整人。那这背后的原因又是什么呢?在大臣审问允祉时，允祉曾当着雍正的面，自称是皇上的兄长，怒斥众人，这让雍正觉得颜面大失，结果，表面上雍正对允祉从轻发落，允祉被拘禁，降亲王为郡王，撤掉所属的四个佐领；但实际上，弘晟成了他父亲的替罪羊，被锁锢于宗人府。雍正同时剥夺了允祉的参政权，并且告诉他，以后一切交于诸王大臣会议的事情，你就不必参加了。
冰冻三尺，绝非一日之寒，允祉被降爵位，并不只是因为这一件事。雍正为整顿国家财政、力追亏空之项，允祉也受到追查，他对四弟的做法很不满。雍正一方面对允祉的亏空穷追不舍；另一方面又分两次私下赐银共十五万两，以表示公私分明，并且也借此笼络他。但是，允祉并不领这个皇帝的情。还处处和雍正作对，对于雍正宠幸的臣子，允祉极力诬谤。还说：“这些都是欺上瞒下的人，哪有一个可以信赖!”雍正每次夸赞允祥，希望允祉学习他的品格，允祉都置若罔闻。相反，对雍正罪怪之人，允祉则表露出同情之心来。允禵再次被夺郡王爵位时，他的儿子弘春也同时丧失贝子爵位，允祉在乾清门众目睽睽之下，为允禵父子叹息流涕，亲近雍正的敌对势力。但是在背地里，允祉还对雍正说：“允禟等人能成什么大事，如果换了是我，我就可以置他们于死地。”这原本是想讨好雍正的话，可雍正则认为，允祉的用意在于暗示他置允禩等人于死地，让天下的人骂他这个皇帝不仁不义。
除此之外，允祉还有一点最让雍正心怀怨恨。多年来，允祉进见，雍正总是优礼赐坐，向他诉说自己忧国忧民的心情，而允祉从来都没应答一个“是”字，也从没点头表示肯定。相反，每到这个时候，他却向雍正述说自己闲暇之时所作之事。允祉为何这么做呢?他之所以不谈政事而说生活乐趣，无非是想避嫌自保，可雍正却理解成他想诱引自己荒废政事。两人之间确实误会颇深。
到了雍正八年(1730年)二月，雍正借对五个幼弟加封爵位的机会，降旨说：“允祉最近已经认识到了自己以前犯的错误，深深地感到愧疚和悔恨，就恢复他亲王爵位吧!”可是，好景不长，从那之后刚好三个月后，允祉再次倒霉运。
雍正八年五月五日，被雍正誉为“宇宙之全人”、“擎天之柱石”的怡亲王允祥病逝了。雍正此时也在患病，又恰逢爱弟溘逝，心绪自然坏到了极点。允祉早就对允祥得宠十分妒嫉，所以对弟弟的死不但不难过，还深感庆幸。雍正大肆褒扬允祥，特意准备隆重地置办丧事，允祉更是不以为然，甚至有些消极对抗的表示。当人们奉旨在诸王府宣读传示雍正褒扬允祥的谕旨之际，允祉不屑听这些夸赞的话，傲然离去；雍正的十七皇弟果亲王允礼为了讨好皇上，不顾体弱怕暑，仍然恳请穿丧服，而允祉既不照样做戏，又不躬请“圣安”，反到在人们争先恐后地去怡亲王府齐集吊丧时，每天迟到早退，全然没有一点伤心的表现。对此，雍正怀恨在心，决心一定要对他严加惩治。
五月十九日，雍正降发谕旨，历数允祉的种种“罪行”，新账老账一起清算。形成十大罪状，以《大清律》中“不孝者斩，大不敬者斩，紊乱朝政者斩，挟诈欺公妄生异议者斩”为根据，建议：允祉罪大恶极，应该削掉他亲王的爵位，革退宗室，立即将他正法；允祉子弘晟也革其宗室，一同正法；另一子弘景应革去公爵，与其他诸子孙一样，交旗更名，披甲当差；其余家属及财产都做适当处理。但是雍正一想到允祉也没有做什么罪大恶极的事，真的杀掉自己的兄长也于心不忍，于是将允祉从宽夺爵，免他一死，禁锢在景山永安亭，家属听其带领侍从；弘晟禁锢于宗人府，从严看管；弘景为人心性未定，不像他的父亲和兄长那么悖逆，仍保留公爵，以观后效。其他家人均编入指定旗内。
允祉过了整整两年的牢狱生活，于雍正十年闰五月十九日(1732年7月10日)病死。
说起来，纵然允祉有很多傲慢无理之处，但是他已不构成威胁皇位稳固的重要因素。所以，雍正惩罚允祉父子，显然多是从维护自己皇威的狭隘政治目的出发，以怨报怨，意气用事，这是没有任何国家利益可言的骨肉相残。
