中国第一个留美学生容闳赴美定居。容闳，字达萌，号纯甫，广东香山南屏镇人（今珠海市），1828年（清道光八年）出生。早年入澳门马礼逊学堂就读，1847年初赴美求学。1854年，他在美国耶鲁大学毕业，并加入美国国籍。1855年，他从美国返回国内，先后担任香港高等审判厅译员、上海海关翻译等职。1859年，他进入英商宝顺洋行，为其采购丝茶，并曾赴天京（今南京）会见太平天国干王洪仁玩，并提出组织新式军队、设武备学堂等七项建议。1863年，他入曾国藩幕，被曾国藩委派到美国购买机器。1868年，他通过江苏巡抚丁日昌，向清廷提出选派幼童赴美留学。1872年，他率留学生赴美，并任留美学生监督，不久又晋升为驻美副公使。中日甲午战争期间，他曾两次上书张之洞，提出借款、购船、雇洋兵以抗日本侵略等建议，但未被采纳。1898年，他参与康有为、梁启超等发起的维新变法活动。戊戌政变后，他离京避居上海。1900年，他参加在上海张园召开的“中国国会”，并担任会长，随即被清廷通缉，被迫出逃香港。本日，容闳为躲避清廷的迫害，正式移居美国。1910年，他曾与孙中山联系，表示赞助革命。辛亥革命后，孙中山曾邀请他回国赞助共和，但他当时已重病不起。1912年，他在美国病逝，留有《西学东渐记》等著作。
5月18日。杨源主持的《岭东日报》在广东汕头创刊，1908年停刊。
杭州中学堂学生进行争取自由的斗争。据本日《申报》报道，浙江省城所设中学堂，由知府宗子材邀请前贵州督学杨雪渔总办一切事务，秀才邵崇伯为监督。学堂学生100名，分为头班、二班，列头班者均曾学习过西文西语，受过自由主权思想影响，平时就看不惯总办杨雪渔的顽固守旧作风，以为他不适合担任总办职务。月初的一天，许多学生正在会餐，间以高谈阔论，大声喧哗，邵崇伯听到后，严加斥责，说他们胡言乱语，有违圣道，但学生们并不服气，惹得邵崇伯更加气恼，便把杨雪渔请来裁判，想借以开除几名言辞激烈的学生。于是，在场学生先自动解散，很快联络30多名学生联名上书宗子材，将邵崇伯的任性妄为、克扣饭食、侵吞公款、中饱私囊等劣迹一一列举出来，要求查办邵崇伯。宗子材虽派人对邵崇伯的所作所为进行调查，但又将带头的几个学生开除，以儆其余。
5月19日。外务部奏准，定出使奥、比、意三国大臣为专使，命候选道许钰任出使意大利国钦差大臣，候补道杨兆任出使比利时国钦差大臣，候选道吴德章任出使奥地利国钦差大臣。
清廷任命肃亲王善耆为步军统领，并命其督修京师街道工程，兼管巡捕事务。
5月20日。清廷下谕免去肃亲王善耆镶红旗满洲都统职务，并不再管理健锐营事务。
5月21日。清廷调荣禄为镶红旗满洲都统，溥伦为正蓝旗满洲都统，任命奕谟为正黄旗蒙古都统。
5月22日。寓沪外商在上海市南京路菜市后洋房内举行花卉展览。
清廷拨银20万两，在北京开工修治道路。
5月24日。清廷任命继禄为正红旗汉军副都统。
5月25日。直隶大学堂创办。直隶总督袁世凯本日在保定创办直隶大学堂，聘美国人丁家立为总教习。
台湾抗日义军数百名志士被日军诱降后，遭日军伏击，全部牺牲。
上海裕源纱厂厂主因苛罚工厂工人，激成工人罢工。
5月27日。清廷命四川总督奎俊督饬下属严密缉拿安岳县杀害教民的义和拳人，认真查禁，务期净绝，并抚恤被杀教民。
5月28日。清廷调张人骏为河南巡抚，吴重熹为直隶布政使；以李有菜为江宁布政使；任命周馥为山东巡抚，锡良为热河都统，英慈为镶红旗汉军副都统，儒林为理藩院右侍郎。
台湾抗日义军首领林少猫被日本驻台湾总督儿玉源太郎杀害，台湾武装抗日斗争进入低潮。
5月29日。锡良奏准，河南自道府以下捐纳保举各员，一律停发三年。
5月30日。清廷任命肃亲王善耆为御前大臣，庆福为泰宁镇总兵兼总管内务府大臣。
5月31日。上海米价陡涨。上海道袁树勋鉴于米价陡涨至每石售价八元三角银洋，本日再次发布告示，严禁囤积米粮，并继续禁止大米出口3个月。
本月。两湖大学堂成立。湖广总督张之洞改两湖书院为两湖大学堂，并创建湖北师范学堂，派梁鼎芬为监督，陈毅、胡钧为堂长。
直隶总督袁世凯仿照西法，在保定创设警务总局一所，分局五所，并任命赵秉钧为督办。
中英商约谈判在上海正式开议，中方代表为吕海寰、盛宣怀，英方代表为詹姆·马凯。
6月1日。锡良创办河南大学。
英国将山海关内外铁路交还清政府。
6月2日。上海县知县汪懋琨发布告示，严禁妇女进入茶馆品茗，并示此举为“以端风化”。
6月4日。清廷以驻防直隶广宗参将马振武、河间知府如松、署广宗知县魏祖德等镇压景廷宾起义不力，下令将他们全部即行免职。
6月5日。上海城厢内外油漆工人举行罢工，要求业主增加工人工资，上海巡捕房逮捕17名工人。
6月6日。两江总督刘坤一、湖广总督张之洞、工部左侍郎盛宣怀以上海各国领事有功于保护南方，特奏请清廷予以奖赏。
清廷督办蒙旗垦务大臣贻谷在归化设立垦务总局。
上海县署在西门内关帝庙中安置留养因遭受风灾漂流到东海洋面的朝鲜难民10余人，并决定在有轮船时再给资遣送回国。
6月7日。山西大学堂开办。山西巡抚岑春煊本日开办山西大学堂，学堂分为中学专斋、西学专斋，以姚文栋为督办，谷如墉为中学专斋总理，英教士李提摩太为西学专斋总理，敦崇礼为西学总教习。
中意签订《天津意国租界章程合同》。直隶天津海关道唐绍仪与意大利驻华公使嘎厘纳在天津正式签订《天津意国租界章程合同》，其中规定：中国“将天津北河左岸上地方一段永让与意国作为租界，该地界内意国全行管理，与别国所得租界办法无异”。“该租界内一切官地，中国国家均行让给意国，专为永业，无庸出价”。“其界内意国不用之地仍准民间执业，任便买卖，但不得卖与他国洋人管业。倘欲或租、或典、或押与他国洋人，于未经意国租界工部局允准之前，不得租出、或典、或押”。“租界内准中国人置地居住，惟须遵照日后意国特行拟定章程”。
6月8日。上海各米店按照上海道袁树勋的规定，每石米价减三角银洋出售。
6月9日。清廷下谕实授袁世凯为直隶总督兼北洋大臣。
6月10日。驻沪领事团通过《上海租界权限章程》。驻沪领事团本日通过《上海租界权限章程》，其中明确规定了公共租界和法租界会审公廨权限，共有四款，主要内容是：“一、钱谷案如两告均系华人，原告应在被告所住之公堂控告。二、华人犯租界章程者，即在所犯之租界公堂审讯……三、钱谷案如原告为洋人并非法人，而被告为华人者：甲、如被告为华人住居公共租界者，即在公共租界控告；乙、原告如为法人，被告如华人在法租界居住者，即在法公堂控告；丙、如原告为外国人并非法人，被告为华人而在法租界居住者，应在公共租界之公堂审理，惟拘票则须由法总领事签名，然后由两租界公堂差役协提，毋庸在法租界先审；丁、如原告为法人，被告为华人而住居公共租界者，应在法租界公堂控告，惟拘票须经总领事签名，仍可由两界公堂差役协提，亦毋庸先在公共租界公堂提审。四、刑名之案如原告为外国人，并非法人，则在公共租界之公堂审讯，如原告为法人，则在法公堂提审。拘票亦须按照以上第三款先经领袖总领事签名，然后由公堂差役协捕往提，与向日办法无异。”
6月11日。上海道袁树勋对上海领事团通过的有损中国主权的《上海租界权限章程》表示无条件同意。
6月12日。上海公共租界工部局筹建电车。上海公共租界工部局本日特邀英国土木工程学会专家斯文勃纳共同磋商筹建电车事宜。斯文勃纳认为，有轨电车铺轨架线虽然投资较大，但其容量大，行车成本低。上海公共租界工部局决定接受斯文勃纳的意见，选定英商布鲁斯电气公司与英国电气运输公司的联合投标项目。1902年8月，上海公共租界工部局与投标双方签订了合约。事隔半年后，布鲁斯电气公司与英国电气运输公司因集资困难，要求延期一年，上海公共租界工部局驳回了上述两家公司的要求，并于1904年2月撤销合约，继而再度招商设标。最后，上海公共租界工部局选定英商布鲁斯·庇波尔公司承办电车工程，双方于是签订合约，上海公共租界工部局给予该公司电车专营权35年。
广西三合会在上思发动起义，并转战桂、湘、黔等地，1905年7月失败。
6月14日。台湾日本当局公布《台湾糖业奖励规则》。
6月17日。天津《大公报》出版。由满族天主教徒英华（敛之）主办的《大公报》本日在天津创刊，并正式出版发行。该报为日报，由天主教资本家柴天宠、朱志尧和法国驻华公使鲍渥、主教樊国等集股而成，刘孟扬、王瀛孙等为主编，英华兼任经理、撰述、编辑之责。该报以“开风气、牖民智”、“通上下之情，作四民之气”、“兴利除弊，力图富强”为宗旨，鼓吹保皇，诋毁革命。该报刊登的社论明白流畅，以敢言著称，都用白话文写成。
6月18日。各省抗捐抗赔款。清廷以各省分派赔款、摊赔教案、抗扪滋事案件迭起，本日命各省督抚核实筹办。
6月19日。清廷命各省督抚认真清查各省卫所屯田，分别妥善办理，并详细上报。
上海县知县汪懋琨再次与上海商业会议公所严信厚及各米业董事会商平减米价，决定再借漕米15万石，分12处平粜。
6月21日。袁世凯创练北洋常备军、设保定将弁学堂。直隶总督袁世凯本日仿效德国常备军制度，制定《北洋常备军营制饷章》，并以新练军为基础，创练北洋常备军，还在保定专门设立北洋行营将弁学堂，派补用道雷震春为总办。25日，北洋行营将弁学堂在保定正式开办，由与王士珍、段祺瑞并称“北洋三杰”的冯国璋担任督办。
云贵总督允许英、法商在滇开采矿产。云贵总督魏光焘、云南巡抚李经羲与法英隆兴公司总办、法国总领事官弥乐石在北京正式签订《云南隆兴公司承办七属矿务章程》24款，允许隆兴公司在云南省境内开采各项矿产。
天津时疫流行，绅商孙仲英等在天津创设保卫医院11所。
6月22日。葡萄牙驻华公使白朗谷从北京经天津抵达上海。
文明书局在上海开办。文明书局由无锡老名士廉南湖、俞仲还、丁宝书等合资创办，俞仲还任经理。该书局与当时社会上兴起的创办新学校、提倡新学说潮流相配合，一开办就首先出版了新颖小学教科书《蒙学课本》，销路颇广。接着，该书局从无锡延聘了中国自制印刷铜版第一人的赵鸿雪，推行用铜版印制书画，其铜版书画在当时超过了商务、中华、有正等书局。这些书和画册不但行销国内，且远及日本和南洋群岛，读者对其评价颇高。该书局还刊行了大量的笔记，如《说库》、《清代笔记丛刊》、《笔记小说大观》等。这些笔记本子很小，携带方便，深受读者欢迎，在学术卜也有一定价值。1932年，文明书局并入中华书局。
6月23日。清廷命张百熙、陆润庠会同顺天府五城御史妥议章程，在北京兴办医局。
（启蒙画报）在北京创刊。《启蒙画报》由彭翼仲、彭谷生主编，初为日刊，次年改为月刊，后又改为半月刊，凡伦理、地舆、掌故、格致、算术、动植物等学科，都分列绘制成图，并配文解说，是学童入学的阶梯。
6月25日。清政府与英国正式订立《上海会审公廨合同》。
6月26日。清政府与日本开始进行商约谈判。
英军入侵西藏干坝宗地区。英国驻哲孟雄（今锡金）专员惠德以“西藏不履行条约”为由，本日率英军百余名闯入中国西藏干坝、纳金地区，并蛮横地限令当地藏族官员、守卡官兵和西藏人民在24小时内撤出该地区。当地中国藏族官民据理力争，群起抗议，但惠德置之不理，并用武力再三威胁，迫使西藏官兵和人民撤出他们世代居住的地方，英军随后拆毁了当地原藏军隘卡，并向北侵至西藏干坝宗南思补纳山一带，修立界石21处。清政府驻藏大臣裕钢和清廷获悉此讯后，分别向英印总督和英国驻华公使提出了强烈抗议，裕钢还派知府何光燮前往商谈，中英双方于是开始了藏哲边界谈判。
6月28日。京师大学堂总教习吴汝纶抵达东京，开始考察日本教育。
6月29日。上海澄衷学堂获光绪帝御书匾额。光绪帝为澄衷学堂御书匾额一方，上书“启蒙种德”四字，由督学部特派专人于本日送至上海。上午10点，上海道袁树勋、上海县知县汪懋琨及下属各官陪同督学部专员，敬送匾额至上海市虹口塘山路（今唐山路）的澄衷学堂。澄衷学堂是上海第一所由中国人创办的“洋学堂”，由宁波旅沪巨商叶澄衷捐资10万银两创办。1901年春，校舍落成并招生开课。校内设备齐全，学生免缴学费，另发给书包、课本及竹布长衫。一时间，该校声名远扬，人所称道。为此，当时任商约大臣的吕海寰、盛宣怀有感于叶澄衷出资兴学之举，特奏请光绪帝颁赐这块御书匾额，以示嘉奖。
6月30日。清廷命各省督抚切实剔除新旧偿款过程中的弊端，以纾民力。
本月。直隶总督袁世凯在保定创设北洋军政司，作为直隶省练新军的负责机构，自兼督办。
四川资阳义和团聚众千余人夜袭天鼓桥地方的美、英教堂，资阳“樵夫牧竖”踊跃加入义和团，号称“仇洋灭教”，群起焚毁教堂。四川总督奎俊率兵镇压，并将资阳知县撤换。
四川仁寿、简州、金堂、华阳等地义和团“纠众接仗”，英勇奋战，进逼龙潭寺，省城成都戒严。
周学熙奉直隶总督袁世凯之命，在天津创办银元局。
黑龙江瑷珲霍乱蔓延。
7月1日。工部左侍郎盛宣怀与商约大臣吕海寰偕英国公使马凯由上海启程赴南京、湖北，准备与两江总督刘坤一、湖广总督张之洞会晤商约事宜。
7月2日。清廷谕准两广总督陶模因病乞休。
7月3日。清廷命德寿署两广总督；调岑春煊为广东巡抚，丁振铎为陕西巡抚；任命王之春为广西巡抚。
清廷命外务部与总理耶稣教会事务李提摩太商议民教相安条规，以期缓解民教矛盾。
7月4日。出使日本国大臣蔡钧致电直隶总督袁世凯，称日本外务部已答应与英国一起帮助清政府收回天津，望清政府加快速度，切实变法。
上海道袁树勋饬令上海城厢内外平粜大米赈灾。
7月5日。议和全权大臣奕照会德、英、俄、法、日、意六国驻华公使，请各国交还天津。
