保护区位于那曲申扎县附近，建立于1993年。后来更名为“色林错黑颈鹤自然保护区”，包括的范围更大，申扎、尼玛、那曲、安多、班戈等地的黑颈鹤栖息地都包括在内。2003年6月晋升为国家级自然保护区。
这里是鸟的乐园，聚居的鸟类有120多种，景象异常壮观。
申扎自然保护区正处于羌塘内流区南部大湖密集的宽广湖盆地带，面积4万平方公里。区内的格仁错水域面积476平方公里，水面高程4650米。格仁错东南部是黑颈鹤主要的栖息地。保护区海拔稍低于羌塘高原中北部，气温稍高，有少量农田可种植青稞作物。这里年降水量只有300毫米，但受到冈底斯山顶冰川与积雪融化的补给，湖水矿化度低，适于水生生物与水禽生长和繁衍。低洼湖区内广泛分布着大蒿草等组成的沼泽草甸滩地，加上巴汝藏布、申扎藏布等内流河，使这里发育着良好的内陆湿地和水域生态系统，成为国家一级保护动物黑颈鹤的理想栖息环境，是国内现有7个黑颈鹤保护区中海拔最高、面积最大的一个。
黑颈鹤是典型的候鸟。每当严寒降临，黑颈鹤飞到喜马拉雅山北侧聂拉木县一带气候温和的地方过冬；待高原气候变暖，又飞回藏北高原，度过春、夏、秋3个季节。每年3月，它们排着“一”或“人”字队形，由西藏南部迁居西藏北部，选择人烟稀少、有山峰为屏障，有食物可寻觅的开阔的湖泊、河流、沼泽作栖息地。它们往往五六只成群，多则数十只，嬉戏寻食，选择伴侣。很有意思的是，黑颈鹤休息时常常把一只脚缩到腹部下边，头插到翼下，单脚独立或者用嘴梳洗羽毛。
黑颈鹤能与其它鸟类和睦为邻。尽管小小的棕头鸥有时凌空俯冲而下，或尖叫恫吓、或戏弄它，它也并不反击，反而低下脑袋，垂下尾巴以示谦让。但是在“生儿育女”期间，它绝不允许同类鸟接近自己的巢区。
4月底5月初，黑颈鹤进入繁殖期，成双成对的“情侣”离群而去，寻找被水隔绝的较为僻静的干草墩或苇草丛构筑巢穴。巢穴完工后，成双的黑颈鹤便两头相对，伸展抖动双翅翩翩起舞，求爱交尾。5月底开始产卵，多数一窝产两枚。30天后雏鸟出壳。小小的幼鹤羽绒一干就能独立行走。3个月后，羽毛丰满的小鹤就练习飞翔了。令人不解的是雏鸟采食时，相互间经常发生激烈殴斗，有时斗得头破血流，甚至一方丧命，而它们的父母在一旁却置若罔闻，不管不问。这种自相残杀、危害生命的现象，现在已经引起科学工作者们的关注。
