晶石疗法用的水晶，是晶体石的总称，它包括了水晶、黄晶、紫晶、玛瑙和各种晶体石。现代科学家发现，如果你在一片薄薄的水晶上施加压力，就可以从中压出一种电流，发射出能量，这种能力称为“压电效应”。水晶的原石晶体不但能传送能量，而且具有接收和储存能量的功效。
水晶的保健作用按照现代科学观点，可以从以下几个方面来理解：
一、天然水晶具有特殊的“压电效应”，无缺陷的水晶单晶经加工成饰品佩带人体后，与代人体摩擦可以产生微弱的电磁场，这种电磁有稳定情绪、促使人体能量集中，减轻病人痛苦和紧张，回忆痊愈速度等功能。美国研究中心所推崇的“水晶疗法”，就是将水晶按压在病人伤处起辅助治疗作用。
二、从水晶的光学特性看，水晶属三方晶系一轴晶正旋光性结晶体，有三个方向的光轴，当按方位精工切削琢磨后，光轴方向往往会产生一定聚光、放光功能，当其刺激到人体某一穴位时，可以产生一定的理疗作用，国外报导的用水晶治疗少儿骨折、乳腺癌等均基于这一道理。
三、从生物地球化学观点来看，水晶同其它宝石一样，形成于特殊的地质构造环境，含有部分对人体有益的微量元素，如铁、铜、锰、钛、锌、镍、钻、硒等，烟水晶由于形成时受到地下放射性照射而保留有少量放射性元素（含量极微，不会对人体有害，反而类似放射疗法），这些微量元素通过与人体的经常摩擦而会沿毛细孔、汗腺浸入到人体内而促进体内微量元素平衡，使身体各部分更加协调。
