崇祯五年六月十七日，余婉琴、哈日珠拉、娜木钟以薛六、纪天恩的薛家军为中军主力，集结八万大军与建虏皇太极部决战，而皇太极也率领蒙满联军十七万人马迎战，战场上是旌旗蔽日刀枪如海，战斗是从已时开始的。
皇太极首先派出的是喀尔喀三部的三万骑兵，面对的是薛家军薛六、纪天恩的主力部队，只是一场野蛮对文明、愚昧对先进的战斗，在短短的半个时辰的连环攻击中，喀尔喀三部在草原上留下上万的尸体，而愚蠢狂妄的喀尔喀三部几乎没有摸到薛家军的影子，这时喀尔喀三部才明白自己成了皇太极的替死鬼。
就在喀尔喀三部自怨自艾之时，札鲁特、巴林、奈曼、敖汉、喀喇沁、土默特、阿鲁科尔沁、翁牛特、阿苏特等部联军被皇太极推向了一线，对薛家军中军发起猛攻，与此同时多尔衮、多铎率领金国八旗进攻薛家军两翼，十七万对八万煮成一锅。
薛六、纪天恩的薛家军的火器非常强悍，札鲁特、巴林、奈曼、敖汉、喀喇沁、土默特、阿鲁科尔沁、翁牛特、阿苏特联军一上来就被打得抱头鼠窜，与其说是是打仗，不如说是薛家军在屠杀无知的野蛮民族，仅仅一轮进攻投靠皇太极的蒙古军就死伤了七八千人。
多尔衮率领的正黄、正蓝、镶蓝旗和蒙古军四万人马杀向薛家军左翼，薛家军左翼娜木钟帐下猛将宝音，米脂高家军寨高一功、王平所部近两万人马，高一功、王平所部的手雷、火铳给多尔衮部大量杀伤，双方陷入了僵持状态。
多铎率领的正黄、镶白、镶红旗已经蒙古军四万人马，对上了哈日珠拉的手下阿如罕、其灭塞的飞鹰旗，双方也是一场混战，阿如罕、其灭塞仗着火器之利，打得多铎部基本上还不起手。
皇太极对薛家军非常畏惧，这次在对察哈尔林丹汗部大胜后，皇太极通过喀尔喀三部了解到，薛家军主人薛云已经统一漠北三汗部，正在向西向北追歼异族残敌，班师回大明是迟早的事，所以皇太极才觉得时不待我，要在薛云没有回到明朝之前，把薛云的根基薛家军全部消灭掉。
可是作为试阵的喀尔喀三部跟薛家军一交锋，皇太极就觉得不对劲，怎么薛家军的火铳打起来更加犀利了，特别中军真正的两千火铳，打起来就没完没了，简直就是在屠杀喀尔喀三部的勇士嘛，面对薛家军突然增强的实力，皇太极心子把把都紧了，对这场大金国对薛家军的对决产生了一丝不祥之兆。
皇太极把目光投向了身边的汉臣范家主，负责对明朝情报和商务的张家口范家家主，金国汉臣四大臣之一的范家主说道：“大汗，这应该是传说中的西洋火枪，不过比传说中的西洋火枪更厉害，这种火枪可遇而不可求，不知道薛家军怎么会有这么多好火枪。”
皇太极听了不仅没有解惑，而且是更加的郁闷，这薛家军果然鬼名堂多得很，好在喀尔喀三部本来就是拿来消耗薛家军实力，这才使得皇太极勉强能够接受，当皇太极发动全面进攻之后，札鲁特、巴林、奈曼、敖汉、喀喇沁、土默特、阿鲁科尔沁、翁牛特、阿苏特联军依然是皇太极拿来消耗薛家军的替死鬼。
半个时辰过去了，皇太极寄予厚望的多尔衮、多铎左右两翼，并没有取得什么进展，而札鲁特、巴林、奈曼、敖汉、喀喇沁、土默特、阿鲁科尔沁、翁牛特、阿苏特联军却垮了下来，皇太极只好派出了第三批人马出战。
第三批人马是由李永芳、薛斌和朝鲜军韩润部等两万余组成，这些由汉奸、朝奸组成的队伍，血气不下于建虏的八旗牛录，在李永芳、薛斌、韩润率领下，一鼓作气扑向了薛家军中军，在付出了五千人的伤亡后，这些汉奸、朝奸居然成功的实现对薛家军的短兵相接。
不过由薛九、薛庆益、肖参将、刘参将组成的预备队立刻参战，在最短的时间之内击退了李永芳、薛斌、韩润联军的进攻，薛家军立刻调整阵型，这时皇太极投入的镶黄、正白两旗已经气势汹汹的杀到，紧接着薛家军跟皇太极的王牌队伍又是一番混战。
皇太极看到自己的人马终于跟薛家军混合在一起了，十七万对八万皇太极对获胜充满了期待，可是面对薛家军的战斗，已经不是单纯依靠人多势众的冷兵器时代了，在代表了先进和文明的薛家军面前，愚昧落后的野蛮部落最终将被历史抛弃。
在这次薛家军和皇太极的大军决战中，薛家军使用了代表先进生产力的前膛火枪两千多支，火铳六千支、手雷十三五颗、炸药包八千个、燃烧瓶三千个，还有八万支短柄长矛，战争之神站在了薛家军这一边。
薛家军同皇太极的蒙满大军混战一个时辰之后，在手雷、炸药包的爆炸声中，皇太极的镶黄、正白两旗首先出现溃退，接着蒙古汉军开始逃跑，从而演变成了皇太极大军的大溃败，十几万大军铺天盖地的向东北两个方向逃窜。
薛家军开始全线追击败兵，这时娜木钟让乌云娜的万人队投入了最后的进攻，娜木钟希望乌云娜能够为薛家军建立殊功，乌云娜跟娜木钟有一个约定，就是成为薛云的侧妃，乌云娜率领自己的万人队直追皇太极的金帐，要借皇太极和建虏的贝勒、贝子的人头，作为觐见薛云的见面礼。
薛家军的追击以天黑结束，这一仗薛家军歼灭皇太极大军八万多人，其中俘虏的只有三万人，缴获的牛羊驼马数十万，其他金银皮毛粮草帐篷等物资不计其数，不过薛家军也付出了三万多人的伤亡，其中牺牲的将士就达到一万二千多人。
作为有生力量投入战斗的乌云娜部，乌云娜追赶皇太极时，里皇太极最近时不过二十个马步，最终还是让皇太极逃掉了，不过乌云娜还是一箭射死了皇太极身边的大汉奸范家主，并活捉了朝鲜叛徒韩润。
皇太极退往辽西跟随的人马只有五万左右，基本上都是女真、汉军、朝鲜军，蒙古部落不是被消灭，就是逃回自己的部落了，皇太极带着十万人马征讨蒙古，眼看着大获全胜，哪知道跟薛家军一战，倒赔进去了五万人马，现在皇太极死的心都有了，自己怎么老是犯糊涂，去跟薛家军硬碰硬，最后的结局证明依然是头破血流。
皇太极悲伤对豪格说道：“儿呀，大明有了薛家军，就没有我们女真人欺负汉人的机会，你要记住只要守住祖宗的长白山就是了。”
皇太极说完是不住的咳嗽，不远处的多尔衮、多铎鄙视着皇太极，大汗一场败仗打下来，就丧失女真男儿的血气，在这次跟薛家军的对决中，多尔衮、多铎率领的左右翼损失相对较少，得到了八旗各牛录的拥护，多尔衮、多铎二人在想，皇太极这个痨病鬼一死，豪格能不能当上大汗可不是你皇太极的遗言说了就算数的。
薛家军取得对金国大战的胜利后，皇太极率领残兵败将逃回了盛京，蒙古暂时被建虏放弃了，大批的蒙古部落开始向娜木钟或者哈日珠拉称臣纳贡，林丹汗失去的领土和人口，漠南蒙古大部分回归到娜木钟、哈日珠拉帐下。
当薛家军以优惠价格处理一大批皮毛给等候的杭州商人时，这些杭州商人对自己在大同城多呆一月，得到如此优厚的回报，仅有的一点抱怨也变成了欣喜，在纪天恩的护送下，浩浩荡荡返回江南杭州。
林丹汗逃到呼和浩特后，在成吉思汗陵前举行庄严的仪式，宣称自己为全蒙古的林丹巴图鲁汗，遂带领察哈尔、鄂尔多斯余众，移动成吉思汗之陵，西渡黄河至大草滩。林丹汗在大草滩永固城一带拥众落帐，重整旗鼓准备东山再起。
年底林丹汗得知大福晋娜木钟联合薛家军战败了皇太极之后，林丹汗是又高兴又愧疚，要是早听薛家军的话，自己也不至于逃到大草滩永固城，于是林丹汗派人去跟娜木钟联系，准备过了冬天就重回察哈尔部。
哪知道就在这一年冬天，心力交瘁的林丹汗病倒了，于第二年返回察哈尔的计划拖延下来了，经过一年的病痛折磨，身体虚弱的林丹汗开始“发痘”，一天天的消瘦下去，终于在崇祯七年四月，死在了青海的打草滩阿拉他拉，苏泰大福晋的儿子察哈尔？额尔克孔果尔额哲被立为大汗，仍驻扎在河套地区，可是稚嫩额哲难以服众，原来跟着林丹汗的部落纷纷散去，最后额哲除了拥众万人和母后手里的传国玉玺之外，已泯然成为一个不起眼的小部落了。
崇祯五年七月朝廷处死了登莱巡抚孙元化与总兵官张焘，宋光兰和王征、余大成等充军；继任登莱巡抚谢琏与知府朱万成，刚到登州又被诈降军所挟持，崇祯皇帝勃然大怒，决心集中朝廷大兵进剿，以浙江朱大典接任山东巡抚，太监高起潜监军，领关宁军五千人等诸军共计三万多人围剿叛军。
崇祯五年八月，孔有德开始几战告捷，由于过分轻敌，结果在沙河遭到辽东骑兵袭击，孔有德损失半数部队，大将陈有时战死。叛军不得不退守登州死守，至此莱州之围已解，接着大明官军进围登州，叛军都元帅李九成战死，叛军军心逐渐混乱，孔有德有心放弃登州去辽东投靠建虏。
