“是那些人让格洛丽亚促成她的总统竞选，但格洛丽亚对这个策略很担忧，她说她想知道上帝真正想要她成为什么。12月24日，她请求普丽丝·耿波阿和我与她一起进行一天的静修，请求上帝帮助她辨别哪条路是他要她选择的。所以，普丽丝·耿波阿和我与她一起，一整天回忆事情的全过程，我们祈祷又祈祷，希望格洛丽亚能够找到她适合走的路。这就是为什么，我那一年我没有给任何人送圣诞节礼物。因为，我把该拿去买礼物的时间花在和格洛丽亚与普丽丝一起了，我们祈求出路。令人开心的是，我们非常成功。那一天快结束的时候，格洛丽亚得到了启示。她知道她应该怎么做了：她非常肯定。她应该退出总统竞选，转而竞选副总统。不，她一点都没有觉得难为情。格洛丽亚不是一个固执己见的人：她不是那种转不过弯儿的人，一头走到黑，拒绝，停止，改变策略，就这么简单，不丢面子。然而，格洛丽亚决定，她的引导者可能感觉得到，委屈她自己，选择一个新的低一点的路，重新开始。通过这么做，她恢复了信心和热情。她就是这样的人。”
对！参选副总统。这是阿罗约的一个转折性的决定。
在决定参选副总统前，阿罗约阵营的钱已快用尽，团队也面临破产的窘境。但阿罗约一决定参选副职，她的情况马上好转。因为在副总统的竞选上，还没有人的声望超过她。竞选的得力助手，阿罗约的丈夫米格尔这样形容当时的形势：“照我说来，当我们宣布的时候，我们已经彻底破产了。但马上，越来越多的钱源源不断地流进来。”
就这样竞选资金的难题立马解决了。
对于这个决定米格尔也非常的满意。“开心，”米格尔说，“谢谢格洛丽亚的退出和洞察力（实际上光顾了她两次），我们足够聪明在罗库之前进行转向。一开始的时候我们并不开心。那个圣诞节我们只有一个客人上门。然而，在得·文莱西亚的阵营里，来访者挤满每个屋角；而在埃斯特拉达的阵营里，人满到屋顶上去。”
但阿罗约自己回首时，心里却并不轻松：
“看起来其实并非如此，我走上副总统的路并不轻松。我要面对不少障碍和许多对手，他们希望我一蹶不振。我看到参议院的诡计，使我失去了所有委员会成员的资格。我受牵连于非法赌博、毒品和其他荒唐的问题。在那个异常低落的时期，没有人管我的死活。但我走过来了。并且，现在我是作为副总统站在全国人民面前。今天我有两个角色：一个是副总统，另一个是社会福利部部长。”
从竞选总统转到竞选副职，虽然看起来是一件丢了面子的事但人民对她却是绝对的认可。1998年，阿罗约以1300多万票，高于第二名和第三名竞争者得票总和的高票当选菲律宾副总统。她又迎来了事业的另一个高峰。
作为副总统，她的工作多数是礼仪方面的：出席官方集会；接见上层和下层的来访者。
“作为社会福利部门的负责人，现在我的工作可以做很细致改变：我在的位置可以具体地帮助我们贫困的农村民众、平民。作为副总统，我希望保证经济发展，前任政府的管理可以不受约束地继续发展。然而，我知道，我们伟大的国家有很多产品和市场。这是‘人民’的国家──并且作为社会福利部部长，我要照顾人民的生活。”
当选副总统后，阿罗约处理了非常多的议案：济贫的计划、早产儿护理、托儿所中心、每个城镇的药房、收留无家可归的孩子、受虐妇女治疗中心……
她处理事的风格犀利果断、游刃有余，人民也越来越喜欢这个女副总统的领导。
权利的颠峰
当上副总统后，阿罗约积极的参与国家的建设，她愿意为这个国家献出自己的所有。
2000年是阿罗约当选副总统的第二年，但她并不感到轻松。政府此时面临了很大一个问题。人民发现由他们投票竞选上来的总统有很多的问题。
2000年5月──政治风云突变。让总统埃斯特拉达下台的呼声越来越高，甚至出现了很多要求他下台的示威游行。然而，副总统阿罗约夫人还是坚决地站在她上司的身后，拒绝用“无声的抗议”和“有声的抨击”来表示全国上下的不满。她说她相信，绝大多数的民众还是希望伊拉普继续当总统。
她对政府的信心没有动摇。“在经济和政治上，我认为政府做得很好，虽然我们可能要更注意地听取国人的建议。但是，我们有许多可喜的指标数据显示目前我们已经从亚洲经济危机中复苏。去年，我们的GNP是3.6％，并且，今年我们还有更好的机会来提高它。”
但是对于总统，民众越来越不满，这种愤怒也在积蓄。终于在2000年的10月爆发了。成千上万的民众涌上马尼拉的街头，要求总统埃斯特拉达下台。
当时阿罗约和丈夫米格尔正在土耳其的伊斯坦布尔进行国事访问。当听到消息后，在菲律宾宗教领袖和众多政治朋友的建议下，阿罗约果断地与腐败的上层划清了关系，她辞职了。
10月17日她回到马尼拉立即得到了民众的支持。结果曾经作为政府副总统的她在这时候变成了最主要的反对派领导。
她没有参加任何公开的反对总统的游行，但是，她将和所有反对伊拉普的组织对话，努力去成立一个反对的联盟。对一般的政治党派，她的目的是调和所有的党派团结起来，步调一致。
当然，阿罗约也有反对者。
对于所面临的问题阿罗约都一一化解，也逐渐得到更多民众的认可。而这些认可的最终结果是把她推向了国家权力的顶峰——总统之位。
2001年1月20日，星期6正午，马尼拉菲律宾最高法官喜莱里奥·大卫主持了，53岁的原副总统格洛丽亚·马卡帕加尔·阿罗约的总统就职大典。菲律宾第十四任总统就这样诞生了。
她的就职演说辞很简洁。有些人说，她的开场白是：“怀着最大的谦卑，我接受共和国总统的职位。”可是，另外有一些人说，她真正的说辞是：“我接受了这个特殊的荣誉和责任，担任共和国的总统。”这是律师最喜欢的谜一样的言辞。
她后面的讲话还是有争议。一些人说，这是母性的传统。但另一些人欢呼，这是一个革命性的召唤，摘要如下：
“人民力量和‘统一’的愿望与展望，使新的开始成为可能。”
“为了新菲律宾的追求，我们从旧时代脱颖而出。”
“我们必须大胆地树立我们国家的雄心，所以，此后的10年，我们与贫困的斗争将赢得胜利。”
“加盟我，让我们把隔在我们之间的墙推倒吧。”
整个午间充满了欢呼声，在路口的人群，欢呼雀跃，迎接新礼物，这是上天赐给国家的，以此维持国家的新希望。
巩固
2001年，阿罗约虽然登上了权利的顶峰，但她的地位并不完全巩固。因为前总统埃斯特拉达也是民选总统，也有相当的支持者。
2001年4月25日下午，菲律宾反贪污法庭向前总统埃斯特拉达发出逮捕令，罪名是不可以获得保释的侵害国家经济罪。随后，埃斯特拉达被关进了国警总部克楠美军营里。消息一传出，激起了埃氏众多支持者和崇拜者的强烈不满，他们开始聚集在克楠美军营附近的乙沙圣殿广场声援被囚的埃斯特拉达。这些声援者多数来自大马尼拉市，以贫民阶层为主。
4月26日，在菲律宾的圣殿广场，数量众多的抗议者高举埃氏的总统画像和各类标语，情绪激昂地要求现政府立即放人，并高喊现总统阿罗约下台，但现场秩序很好，人们对外国媒体也很友善。这些集会者主要由几类人组成，一是埃氏坚定而狂热的支持者；二是认为阿罗约政权接替前政权违宪的质疑者，这部分人以正在享受假期的在校大学生为主；三是一些无所事事、无处可去、看热闹捧场的无业游民，他们看见哪里人多就奔过去看热闹；除此以外，希望赚点小钱的小摊贩们也没放过这个机会，他们穿梭在示威的人群中，不失时机地推销着东西。
28日，在广场上集会的人更多了。据把守在集会现场外边路口的警察估计，抗议的人数已经达到了20万。集会现场的气氛熙熙攘攘，集会组织者更是直白地宣称，是马卡蒂金融中心区的富人们把埃斯特拉达赶下了台。显然，与出身名门的阿罗约总统相比，埃斯特拉达更易为贫民们接受。
4月30日是阿罗约新政府满百天的日子。5月1日凌晨2时半，一支5万多人的示威队伍来势凶猛地冲过5层路障，围攻和冲击了阿罗约的总统府。暴乱者们用石块木棒等攻击前去维持秩序的军警，但菲律宾军警仍保持在民众面前“最大容忍”的一贯态度，结果一名被抢走手枪的警察被暴乱者打死。暴民们抢劫了总统府附近街道的店铺，并放火烧了电视台的实况转播车。总共有4人在冲突中死亡，上百人受伤。这起事件成为菲律宾15年来最严重的暴乱事件。
