神农得了赫鞭之后，与玄都大法师拜别之后，再次行走洪荒。他自上一次毒性发作后，因祸得福，激了血脉，丹田生出真气种子，身体更是强壮不少。寻找与人族有益草木期间，开始琢磨体内真气妙用。
这真气当真是妙用无穷，神农越是琢磨越觉的有无穷玄机。随着对真气认识越来越深，神农意识到这种神通对人族的巨大作用。若是把体内真气悟透，传于人族，日后人族外出打猎，便能减少伤亡。
据说人族远古之时，有大神通者，名为武士。护持人族，让人族不为野兽所伤。自己要是悟出一种真气修行法门，便是不能重现人族远古盛世，也能让人族力量大增，再辅以药草之力，说不定能就突破人族百年寿限，使人族长寿。如此一来，生者多于亡者，部落实力便会越来越强，实乃功德无量之举。
有了这种想法的神农，心中更加坚定起来。走遍荒山野岭，寻找各种药草，每日休息的时候，便开始琢磨真气妙用。
如此又过了十数年，神农已经记下上千种对人族有益的药草，更是找到数种可能种植的种子。便寻找到一处山林，开始编篆草经，苦悟真气修行法门。
日子一天天过去，神农花了十年时间编成一本草经。这十年间，他自山林中开辟出一块田地，开始试种药草乃食物种子，搭起一座木架，尝试着保存药草之法，储存粮食之法。最终是了数千斤各种粮食，神农以丝织布，把这些粮食装好，准备带回族中种植。
又花五年时间创出一种真气修行之法，此时神农已经有七十多岁。因遍尝百草，又修行真气，看上去竟然只有三十多岁。大功将成，神农念及族人，便急着赶回部落，要把自己这些年掌握的知识传于族人。
神农尝完百草，为洪荒人族找到了医病祛邪的草药，又创出真气修行法门，便下山回去。等他离开这片木林后，晾晒药草与粮食而遍山搭木架突然不见了。原来，那些搭架的木杆，因助神农编著草经，制取粮食有了大功德，落地生根，淋雨吐芽。年深月久，竟然长成了一片茫茫林海。
此后，人族为了纪念神农尝百草、造福人间的功绩，这处神农编草经种粮食的一片茫茫林海，取名为“神农架”。
神农回到部族之后，上一代族长已经去世。族人想推举神农为族长，没想到神农五十年没有回来，以为他客死异乡。
如今神农竟然回到族中，还是一副当年出去的样子，族中老人见之大奇，传其得了天神之助。族长禅位于他，神农成为部落之长后，便挑选族中聪慧之人，传与其草经，让他们为族人治病疗伤，族人因伤病去世的逐渐减少。又选部落勇士传达室其真气修行之法，定下武士选拨晋升规则，使部落实力大增，再不怕野兽袭击部落，更让族中吃上肉食。
又教会族人各种粮食之法，烈山部落越来越兴盛，越来越强大。
族人感念神农，把神农编篆的草经取名为《神农百草经》，烈山部更名神农部落。周围部落知神农部兴盛，纷纷来投，神农真心接纳他们，待其如己出，投奔而来的各部落渐渐归心。
如此数十年而过，神农已经过了百岁，却不见衰老，族人大奇。神农之名更是传遍四方，洪荒众部落都知道神农部落有位被天神眷顾之人，族中人人长寿，有实力强大的武士。
有生羡慕者，皆遣族人来神农部求教，神农不藏私，亲自接待这些人，手把手教会他们种植之术，带着他们行走野外认识药草。
神农贤名渐渐被众部所传，伏羲得知后，便决定招神农前去，考较他一番，决定等自己大限到时，把共主之位传于神农。
神农部落北方十万里处，有一个人族中型部落，名叫有熊，依靠在姬水附近，部落首领名曰少典氏。他的夫人两位，一位名叫女登，一位名叫附宝，乃是姐妹，为有氏之女。
有一天晚上，附宝见一道电光环绕着北斗枢星。附宝大奇，跑到落部外的小山上观看，随即，那颗枢星就掉落了下来，附宝由此感应而孕。
少典氏知晓后，与族人传言：共主之母与效外遇巨掌之印，以脚丈之，有孕，十二年生一子，为人主共主伏羲；烈山部，又有神农落地有详兆，贤名传于天下；今附宝观北斗枢星而孕，有熊部当有一位贤人降临。遂传遍天下，众部落都知有熊将有大贤出世。
附宝怀胎24个月后，生下一个小儿，这小儿刚刚出生，有熊部落的外面就来了一个道人。
卫兵自然把有道人来访的事情报告给了族长少典。少典听闻有修士到来，不敢怠慢，放下孩子，急急忙忙迎了出了。
迎到部落的门口，少典看见一穿月白道袍的修士，相貌非凡。少典急忙施礼，问道：“道长前来有熊部，不知所为何事？”
这道人见到少典后，打一稽首还礼，笑着说道：“贫道乃盘古玉清圣人元始天尊弟子广成子，闻有熊部将有贤人降临，特来收令儿为徒，与贫道回山修行。”
少典一听，马上兴高采烈的带着广成子进了部族，去看望小儿。进了屋子后，少典请广成子上座，自己陪在下首，吩咐手下的族人去叫附宝带着新生的小儿前来。
不多时，附宝抱着一个孩子旁边来到。正与少典谈话的广成子的目光不禁投到了那孩子的身上，满意的点了点头，对少典说道：“此子天生的道胎，紫气盈庭，乃是一块璞玉，于我玉虚一脉有缘。”
附宝不知道什么事情，相问少典，听闻了这仙师要来收徒弟，其忙上前，“这孩子初生，还未取名，不如道长给他取个名字可好？”
广成子点点头，低头想了想，忽见部落万里之外，有红光溢出，连忙切算一番，不由面带笑容。原来那里乃 是轩辕丘。传闻轩辕丘乃是女娲伏羲化形孕生之地，便对附宝说道：“这孩子将有大成就，又生于轩辕丘附近，贫道便与他取名轩辕。如何？”
“轩辕？”附宝低声念道，觉悟的这个名字好听，另有玄奥，便兴奋的向广成子行礼，“多谢道长赐名，吾儿便叫轩辕。”
广成子又与他夫妇二人说道：“今贫道特来收徒，此子当为我亲传弟子，贫道现要带其回山细心教导，待十八年后轩辕自会归来。不知二位意下如可？”
附宝闻言不舍，其乃聪慧之人，知轩辕得仙师看中，将来必成大器，便看向少典，见少典微微点头，同意让广成把轩辕带走。
广成子见少典夫妇已然同意便说道：“那贫道就将其带走，十八年后贫道便会放其归来。”说完便驾祥云向九仙山飞去。
却说神农被伏羲招见，伏羲考教了神农很多问题，神农都能答上，伏羲十分高兴，便将神农留在陈地作为自己的助手处理一些事物，
慢慢的伏羲将所有的事都交给烈山氏来处理。如此过了三年之后，神农已经能够很好的处理人族之事。各部落公正相待，便是自己部落有人犯错，也不循私，众部落拜服。伏羲见如此，便决定把共主之位禅于神农。
有一日，突然天空飞来详云，却是人教教主太上老君之徒玄都大法师驾临陈，伏羲迎其入内，玄都大法师对伏羲说：“贫道奉人教教主太清圣人道德天尊之命，前来告诉人皇，人皇已然功德圆满，当将皇之位传于他人，功成身退，到火云洞静修。”
伏羲听到此言大喜，本以为自己大限将临，不久于人世，没想到却来了仙人，说自己到火云洞静修，忙让人准备传位之事。玄都大法师传讯完毕后便回首阳山去了。
数日后伏羲祭拜天地、人族圣母、人教教主，在洪荒人族见证之下，将人皇之位让给神农氏。就见在伏羲将皇位传给神农氏的时候，天上降下霞光照在伏羲身上，须臾霞光散去，就在天降功德加身的时候，伏羲便已恢复了前世的记忆，证得天皇之位。
伏羲转身对神农说道：“皇弟，为兄如今证得天皇圣位，望皇弟好生经营人族，日后功德圆满，定可得与为兄与火云洞再见！”
说完后，又与东方海外瀛台山遥遥三拜后，乘坐由五匹龙马所拉的云车向火云宫而去。
神农成为人皇之后，事皆躬亲，不免把家人冷落。他有一位孩儿，名叫女娃，最得神农喜爱，却也是非常懂事，他见父亲忙碌便也不去打扰，只和部落中的小孩一起玩耍，一日女娃出门玩耍，却看见一个大孩子把小孩子当马骑。小孩都累爬下了，大孩子还不肯罢休。
女娃如此欺人，便走过去，指着大孩子的脑门怒斥道：‘你这个人太不知羞耻，欺负小孩子算什么本事，有力气，去打虎打熊，人们会说你是英雄。‘
