在不破帮助被囚禁的人解开特质镣铐，并解锁壁垒对于那些人体内芯片的监控后（他们内体的芯片并没有取出，时间不允，只好待到将他们成功救出后再行解决），小组成员商议分出４人护送他们与接应小组碰头先行离开。
送走了那批人，薇儿他们明白自己拥有的时间不多了，预计最多１５分钟后那些人就会被发现，支援的人要到达地下最快需要１０分钟，所以他们还有不到２５分钟的时间解决一切。
算起来25分钟也是很长的一段时间了，一般来说，科研基地这样的地方支援小组最多也应该在5分钟异能到达并封锁出入口等，可是就因为这些疯子科学家对这个壁垒的防御力太自信了，才造成现在这一情况。
没错，地下部分，才是科研所核心的真正所在，那些疯子们吃住研究均在地下，Ｄ－１１真正全部的秘密也都在地下。
有不破在，他很快就找到了地下的入口，薇儿等人终于进入到了科研所的核心所在。
进入地下之后，和在地上一样，他们选择了分头行动。
不管选了哪个方向，每个人都不敢置信地看着眼前的一切。
地下部分为4个大区：实验物关押区、实验区、标本区、住宿区。
住宿区分从基地到高级，分别是守卫和实验人员的住处。
实验物关押区，顾名思义，关押那些异能者的地方，不过薇儿他们发现，这些人里有些根本没有异能，只是体术高手或精神力很强大的人甚至普通人都有，那些疯子似乎是想研究几种人之间的不同处。起先看到这个名字的时候，薇儿非常生气，因为从名字就知道那些疯子们早就不把人当人看了。而那泽也很反感的皱了皱眉头。可是当他们走到实验物观察区的时候，之前的气愤早已不算什么，眼前的一切才让他们真正的怒不可遏，因为一向冷静的那泽这个时候甚至也失去了理智，只是想毁掉眼前的一切……玻璃室里，为了实验和观察，被处理成各种样子的人，他们的血液似已流干，他们的目光毫无生气，只剩下似有似无的呼吸，和早已风干的泪痕……有几个玻璃室里，似乎是刚刚从实验区被送回的人，可以看到他们在痛苦的嘶吼，在地板上不停的翻滚，甚至流出了血泪，但这所有的一切都是无声的哑剧，那些人看不到玻璃外的一切，玻璃房外也听不到里面的任何声音……
标本区，分为器官陈列室和完整标本陈列室，完整标本又分异能者、非异能者，非异能者里甚至还细分出体术区和精神力区。在器官室区的一个名为眼睛的陈列室里不破和他的队友看到了上千只各种颜色的不同眼睛……完整标本室里从刚出生的婴儿到十多天再到1个月、2个月……1岁，接下来是儿童区、少年区、青年区……不破不清楚这里到底有多少具“标本”，他只知道在来之前他一直抱着的都只是完成任务的心态，甚至见到被俘战友的惨状他都没有现在这样愤怒和失控，而现在他却发自内心的想要毁灭这所有罪恶的一切！！
当薇儿、那泽和其他小组的成员一路血腥杀来，在地下科研区的中心同时也是实验区的中心汇合时，因为杀戮，每个人脸上出离的愤怒神情都化成了一片冷漠，但眼中却燃烧着无法熄灭甚至愈燃愈烈的熊熊怒火。
他们没想到的是，这个地下实验室竟然还有让他们更为震撼、再次失却冷静，让他们的怒火百倍千倍直直上升的一幕——合成人类！或者，准确来讲，应该叫做“人造异能者”。
不破从实验室总控制机中搜到资料，原来，这个科研所的最终目的就是制造出一只强大的人造异能者军队，帮他们一步一步征服全世。只是由于这个项目一直没有任何突破性的实质进展而没有得到吉布多特军政高层们的认可和支持。但曾经抓住蒂斐亚，并开展这个研究计划却是得到军方和政府的批准和支持的。他们实验过制造类似银针的东西，让普通人成为异能者甚至紫眸异能者，一直没有成功后，他们又实验过把异能者改造成紫眸异能者。他们甚至尝试把异能者的器官移植给普通人，尝试“器官拼接并再生”……后来他们逐步转移到胚胎的研究，人工合成胚胎，增大异能者的诞生率，在胚胎成长的过程中不断注入各种“萃取剂”——从异能者血液升至细胞里提炼出的物质。
当薇儿他们突然闯入地下实验区最后也是最大的一个实验室时，他们在实验室里见到了资料里这个科研所最重要的也是最后的几名科学家，他们正在做的就是一个器官移植拼接实验。
薇儿他们闯入时，他们正在往被实验者的脑中嵌入芯片，用来控制被实验者的思想行动，和监控他的身体内部变化……
看着眼前正在上演的一幕，不破和他的队友们已经开始对那些科学家展开虐杀……
而薇儿的一个冰刃也直接切下了正要将手术刀划向那个躺在实验床上眼眸大睁神色惊恐青年男子头颅的满头白发的科学家的手臂。这个疯子，正是当年挖掉蒂斐亚一只眼睛的家伙。
薇儿没有想到自己也会有如此暴怒残忍的一面——她竟然肢解了那个老头，在他还活着的时候。
那个疯子也没有想到，自己竟然也会有如此一天，被人肢解，在就快要实现梦想的时候却绝望死去，他的怒骂、威胁、诱哄对那些闯入者没有丝毫作用，最后他竟在肉体和心灵的双重痛苦折磨和自己疯狂的笑声中死去，当然前提是如果他还有心的话。
在薇儿解决那个疯子老头的同时，那泽也用木能绞杀了一个邪恶的存在。这样的存在早已不能够用生命来形容了吧。
“啊——我要杀了你们，杀了你们！”其他几个早已杀红了眼的人在突然听到队友尖叫的时候停了下来，却发现，那个躺在实验床上的青年不知什么时候已经被救起，却在被救后抓起身边的手术刀自杀了。
而队友希瑞也是在帮实验床上的人松开舒服时，才发现那人竟然是自己已经失踪十年的哥哥希德。
希德获救后虽然认出了救自己的人竟是亲身弟弟，却无法再忍受被改造的痛苦和屈辱，选择亲手结束自己的生命，他死前的最后一句话竟是，“我不是你哥哥，我是一个怪物，怪物！”这时，希瑞才发现，自己哥哥的手上竟布满了鳞片，他原来修长漂亮的手早已不在，而被接上了怪物的利爪。而希德身上被改造的地方显然不仅仅是这一处，不仅仅被移植了异能者的内脏……
希瑞看到哥哥就这样死在了自己的面前，彻底崩溃，抓起一只手术刀就开始疯狂刺向身边最近的一个穿密封实验装的家伙。
紧跟着，薇儿他们便听到了希瑞发出的那一声仿佛不是人声的嘶吼。
……
背后是一阵高过一阵的爆炸声，和浓浓的烟雾火光，薇儿他们在后来赶到的支援者的协助下顺利离开了基地，离开哈纳，甚至是永远的离开了吉布多特。
有谁会想到，在这样一个看似平静祥和的小星球上竟曾存在过那样一个肮脏之所，而又有谁可以保证，别的地方不再有这样的所在。虽然任务顺利完成，但每个人的心中都是一片沉重。
此刻谁也没有料到，这次的事件让薇儿开始了自己转向成熟的蜕变。
