公元年2065年1月，经历了一百多年的和平后，一些法西斯国家终于忍受不住清净，一场意外成为了战争的导火线。第三次世界大战就此拉开序幕。虽然法西斯国家有十几个大大小小的国家组成，但在中国，美国等霸主面前也算是举步维艰。
战争打响没多久，就陷入了僵局。而在这个时候，由法西斯联盟内部的生物学家研制出一种新型病毒。为了战争的胜利，冷酷无情的法西斯联盟在没有实验的情况下，丧心病狂的把该病毒投入战场，并立刻造成了反法西斯联盟的巨大人员伤亡。战局被打破，法西斯很快进入了上风。而就在投入病毒6个月后，意外出现了。法西斯联盟的生物实验室被一架轰炸机炸毁，释放出实验室这种病毒的病毒源。
灾难开始了，，，，，。这种病毒极速蔓延，起初各国还没太注意，而在一次发现一座空城后，才引起了关注，甚至是轰动。因为城里的几万人类五一不是死亡的，而死亡原因无一不是死于该病毒。各国生物学家在没有任何资料的情况下，也表示束手难测。病毒在没有任何抵抗下，很快的蔓延到地球的各个角落。各种实例证明，该病毒生命力极为顽强，进入人体后，迅速刺激人体的各大重要器官，使其膨胀，最后破坏细胞壁，从而破坏细胞。
2066年1月，病毒散播第12个月，地球人口数量迅速减少到了不到十亿，死亡数量还在增大。地球如陷入末世一般。当所有人几乎陷入绝望时，各国高层商议，建立一个没有丝毫病毒的封闭空间，里面有足够的生存物资，和先进的循环系统，做为人类最后的乐土。建议立刻被执行，代号“方舟”。在全民总动员的情况下，“方舟”终于在一年后被完成。这是个无法想象的巨大空间，占地100多万平方米。封闭空间在进行过真空杀菌后，可保证没有病毒的传播。人类所存活的仅剩6亿人类进行了前无古人后无来者的大迁移，全部进入这个称之为方舟的空间。
