19世纪后期,医学界对病原微生物的研究日益深入,陆续发现一些对人类危害严重的病原微生物和寄生虫病,同时也对与地理分布有关的热带病引起重视。包括在非洲患者血中发现疟原虫后,1884年巴斯德研究所继续研究疟原虫及锥虫。1885年意大利医学家阐明了疟原虫发育史以及与人病程的关系。
1897年,英国热带病学家罗斯深入印度现场调查人体与蚊体内疟原虫的发育史,阐明疟疾的传播方式。1899年,科赫发现了结核菌,1883年发现霍乱弧菌,并在埃及、印度研究证明了霍乱的传播途径。1899年科赫到非洲研究热带病(回归热、牛血色素病),同年又到意大利及南洋研究睡眠病。1903年,意大利学者卡斯特拉尼发现睡眠病的病原是锥虫。
1903年,巴斯德研究所的梅奇尼克夫与卢克斯将梅毒病材料接种猿猴获得成功,1905年德国学者绍丁与霍夫曼一同发现了梅毒螺旋体。可以想象,本世纪初是热带病研究十分活跃的年代。