从城市布局上说，洹北商城宫殿建筑群处于城址南北中轴线略偏东的位置，显示出中国城市中轴线布局的早期特征。
目前，洹北商城宫殿区内已发现大型夯土基址30余处，其中被考古工作者编为1号的基址，位于洹北商城内中轴线南部偏东，整体结构呈“回”字型，东西长170多米，南北宽90米，总面积约1.6万平方米，基址、柱洞、台阶、门道保存完整。其结构严谨，使用的建筑材料十分讲究。基址南庑中部有两处宽达5米的门道。正殿高于当时地面0.7米以上，其台阶前普遍发现用于祭祀的被肢解的动物骨骼。这些均说明该建筑应属商代王室拥有和使用，该基址是迄今为止发现的规模最大的商代单体建筑基址。另外1号基址表面清晰的柱网结构超过以前发现的任何商代建筑。加上保存下来的台阶、门道，特别是周围倒塌着丰富的墙体和屋顶残块，可以最大限度地复原出一座规模宏大的商代宫殿。可以说洹北商城1号基址是迄今发现的所有商代建筑中，能够最大限度地复原其本来面貌（特别是地表以上结构）的一处基址，在中国建筑史上具有重要意义。
在发掘过程中，研究者发现，在宫殿区内，有大面积的红烧土堆积。这些土大部分为红色，而接近于地表部分的烧土则为黑色。研究表明，这种颜色上的差异是因为土在受热过程中，其中铁元素氧化程度不同的结果。由于专家分析这些土可能是倒塌的墙体和屋顶的残遗，所以专家推断，很可能是一场大火烧毁了这座宏伟的宫殿。
而宫殿区一带的古地面是一种深黑色土。这种黑土与殷墟一带普遍分布的棕红色古土壤不同，属冲积土，土壤化程度较高。洹北商城的位置，处在商代古地面从西部的棕红色土壤向东部的黑色土壤的过渡地带。对洹北商城的钻探和发掘，显然有利于认识古代人类社会发展与自然环境变迁的相互关系。
