在巩固了自己的统治地位后，刘庄就开始严厉镇压反对派，强化自己的专制统治。公元70年，刘庄借楚王刘英被诬陷叛乱一案，将刘英屈打成招，把许多无辜之人都牵连进来。这些人中，有的人与刘英素昧平生，互不相识，但刘庄为了一泄多年来对宗室诸王隐忍的仇恨，对刘英所招之人，不论罪名是否成立，一律严惩，再加上拍马屁的官员诬告，造成了众多的冤狱。直到后来有人劝谏刘庄，亲临洛阳监狱查核案情，这才使千余个无辜的人得以释放。
刘庄从小就显出其处处精明的性格，即位以后，他把这种性格投入到工作中，发现了很多问题，然后都严加惩处。有一次，刘庄赐给西域使者10匹丝绸，而负责登计的人误写为100匹，刘庄发现后大怒，急召负责登记的人进殿，命令侍卫将其按住，自己手持大棒，狠狠揍他。还有一次，郎官药崧犯了很小的错误，刘庄抄起木棒就打。在刘庄的躬亲政务和严格监督下，东汉在他统治时期的政府纲纪整肃、吏治谨严，取得很多有效的政绩。刘庄还有一个值得一提的政绩就是，命人修治黄河，制服了黄河水患。
公元65年，北匈奴骑兵进攻河西，烧杀抢掠，无恶不作；公元72年，北匈奴又攻河西。面对北匈奴势力的猖狂侵扰，刘庄见社会安定、国力恢复，因而一改守势，采取积极进攻的战略，于是派遣窦固和耿秉出屯凉州，准备北伐。公元73年，刘庄命令窦固和耿秉会同南匈奴及乌桓、鲜卑等少数民族组成的骑兵部队，北伐北匈奴，拉开了东汉同北匈奴之间的战争序幕。此后，窦固派班超出使西域，班超不辱使命，在鄯善国杀死北匈奴的100多名使者，迫使鄯善王依附汉朝，永无二心，并且将自己的儿子作为人质送到洛阳。从此以后，西域逐渐成为中原帝国的一部分。
