在发菌期菌床菌丝突然开始消失，并且退菌面积逐渐增大，其原因在于发生螨虫等危害。蘑菇生产中很容易发生螨虫危害，一旦发生，前期影响菌种萌发和菌丝生长，后期引起子实体被咬部位变色或出现孔洞或菇蕾萎缩死亡，严重影响产量与质量。
螨虫体小，肉眼不易看清，危害有时不容易被发现。因此，双孢菇播种后7天左右，就要细心观察，一旦发现体小呈扁平或椭圆形、白色或黄色、长有多根刚毛的害螨时，要立即用敌敌畏熏蒸或菊乐合酯、克螨特喷雾或菜籽饼、糖醋药液诱杀等方法将其杀死。另外要搞好培养料发酵、菇房消毒和环境卫生。
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