宙斯娶了许多妻子，儿女无数，珀耳修斯就是他儿子中的一个。此时，可怜的珀耳修斯正和母亲在大海上漂泊。他们被装在一个大箱子里面，箱子顺水漂流，倒也安全。珀耳修斯并不觉得十分难受，虽然里面漆黑一片，但风吹不着，加上宙斯暗中保护着他们前行，很快便安全到达塞里福斯岛。
小岛上长着旺盛的草木，郁郁葱葱，景象宜人。小岛的主人狄克堤斯和波吕得克忒斯正在海边垂钓忽然发现漂过来一只大木箱，觉得十分奇怪。两人对望了一眼，便一起把箱子拖到岸上，由于箱子太重，狄克堤差点潜入大海深处。波吕得克忒斯说：“奇怪，不知里面装的什么东西，说不定是珍珠玛瑙呢！”两人打开箱子一看，原来是一个美貌如花的女子和一个十分可爱的孩子。他们高兴极了，赶紧将他们扶出箱子，带他们回家。狄克堤斯兴奋地说：“这一定是上帝赐给我们的礼物，啊，太棒啦！”珀耳修斯和母亲便留在这个美丽的小岛上，过着幸福快乐的生活。
时间飞逝，光阴荏苒，珀耳修斯长大成人，成为一个勇敢漂亮的小伙子，岛上的人们都特别喜欢他，因为他是那样的正直和善良。不知什么时候，小岛上出现一个女妖，叫墨杜萨。长得丑陋不堪，十分凶残，专门吃人肉、喝人血。岛上的百姓都纷纷背井离乡，躲避女妖的追杀。珀耳修斯必须离开这个小岛，因为他身上流淌的是宙斯的血液，有侠肝义胆，他觉得为民除害是他义不容辞的责任。
这天，他简单收拾了行装，告别继父和母亲，依依不舍地上路了。一路上，他感觉冥冥之中有人在为自己引路，双腿好像不是自己的，径直向南方走去。很快，他来到众怪之父福尔库斯居住的地方，这里妖怪成群，形形色色，十分吓人。但他们都不会伤害珀耳修斯，后来他碰到了众怪之父的三个女儿。
那天，珀耳修斯正在赶路，突然黑烟迷漫，雷声隆隆，大地混乱一片。珀耳修斯不知道发生了什么事，赶紧四处察看，发现三个女人朝他飞来。他急忙躲到一边，拔出锁妖军政府不，厉声喝道：“何方鬼怪，竟敢拦住本爷去路！”三个女儿同时哈哈大笑。珀耳修斯仔细一看，不禁吓了一跳，原来这是众怪之父的三个女儿。她们一生下来就是满头白发，而且三个人只有一只眼睛，一颗牙齿，二条腿，因此轮流使用。很多时候，她们一起行动，这样可省去不少麻烦。珀耳修斯很快冷静下来，巧设计策将她们的眼睛，牙齿骗到手中。三个女人没有了牙齿和眼睛，气得哇哇乱叫，但珀耳修斯不理她们，继续朝前走去。
众怪之父的女儿可不是好惹的，她们联手飞到珀耳修斯面前挡住去路，因为她们最宝的东西在珀耳修斯手中，所以她们不敢惹她他，只请求他把眼睛和牙齿还给他们。珀耳修斯说：“东西可以还给你们，但你们得答应一个条件。”“什么条件？”三个女人一齐问道。“你们必须说出去仙女那儿的路。”珀耳修斯说。无奈之下，她们只好勉强答应下来。
珀耳修斯把东西还给她们，立即向仙女居住的地方跑去。跑着跑着，他竟然飞了起来，简直太神奇了！很快，他飞到仙女的住处，说明来意。仙女十分佩服他的侠肝义胆，赐给他三件宝物：一双飞鞋，一只神袋和一顶狗皮盔。珀耳修斯谢过仙女就返回小岛。他有了这三件宝物，便可任意在空中飞翔，想多快就有多快，而且还可隐身，他能够看到别人，而不让别人看到自己。这为他带来很大的帮助。
他飞过三座高山，来到海峡另一边。这里也是众怪之父的地盘，仓皇另外三个女儿就住在这里。最小的女儿就是害民的墨杜萨。珀耳修斯并不怕她们，他相信邪永远不都胜正。墨杜萨和她的两个姐姐长得无比丑陋，而且一个比一个凶残，普通人看到他们，不是被吃掉就是变成了石头，太可怕了。无数平民百姓成为她们的美食。今天，英勇的小伙子要为民除害了。
珀耳修斯为了不使自己变成大石头，便想出一个妙计来对付凶恶的墨杜萨。他手中拿着一个圆镜，悄悄来到三个女怪居住的洞边，发现她们正在睡觉，珀耳修斯准备下手。他举起镜子，清楚地认出哪一个是墨杜萨，然后拔出宝剑，一刀砍下她的头。墨杜萨丑陋物脑袋在地上滚许久才停下来，乌黑的血溅满了珀耳修斯全身。这时，从墨杜萨的肚子里，飞出巨人克律萨俄耳，幸亏珀耳修斯及时砍提她的脑袋，否则他们马上就会被闷死。珀耳修斯刚想与他们打招呼，但已经晚了，飞马和巨人来不及说声“谢谢”，就向家乡跑去。珀耳修斯命出神袋，将女妖的脑袋放进去，马上离开了山洞。
当墨杜萨的两个姐姐醒来时，忽然发现妹妹的头不见了，急忙飞出洞外，循着血液味道追赶敌人。这时珀耳修斯正高兴地在空中飞翔，突然觉得一阵妖风向自己扑来，一定是妖女追来了！珀耳修斯迅速拿出仙女赐的狗皮盔戴上，于是他就隐形在空中。只见两上妖女乱施法力，就是找不到对方，气得吐出团团黑烟。珀耳修斯虽然没被她们发现，但还是被妖风吹得摇摇晃晃，有些不由自己。神袋口露出墨杜萨的鲜血，一滴滴落到地面上，转瞬间变成一条条毒蛇。从那天开始，人间就有了毒蛇，它们没改变墨杜萨的本性，专门制造各种灾难，来折磨凡间的百姓。
珀耳修斯赶紧扎紧神袋，血就不流了。两个女妖找不到敌人，只好悻悻地回去了。天空中布满了黑云，遮挡了太阳，百姓们以为会发生什么灾难，都跪在神灵面前祈祷，保佑全家平安。一阵惊慌过后，什么也没有发生，太阳露出了笑脸。
珀耳修斯一直飞呀，飞呀，穿过树林，越过高山，但离小岛仍然很远。他实在太累了，准备落到地面上休息。降落了足足有五分钟，才落在地上。他四周打量了一下，原来这儿是一片森林，树木又粗又高，而且树枝上挂着闪闪发光的果子。前面不远的地方，有两个士兵守着一条巨龙，一动不动，可能是看守金果的吧！珀耳修斯十分口喝，真想摘下一个金果吃，但守卫的眼睛紧紧盯着他，所以他不敢动手。忍忍吧，他劝自己说。守卫士兵把他带到国王阿特拉斯宫殿。珀耳修斯恭恭敬敬地说：“陛下，我想在贵国留宿一夜，不知……”他的话还没有说完，国王就不高兴地说：“你看，我们国家到处是金果子，有什么理由让我相信你不会偷金果呢？”珀耳修斯没想到国王会问这种话，一时没答上来。国王立刻派手下将珀耳修斯赶出森林。珀耳修斯看着毫无同情心的国王，愤愤地掏出墨杜萨的人头，放在国王面前，自己背过身去。国王瞪着大眼睛惊恐地望着丑陋的人头，顷刻间，他变成了大石头。
因为国王身材高大，所以他变成石头后，森林里就出现一座高山。国王的头发和胡须变成枯草和树木，胳膊和长腿变成山脊，头颅则变成高高的山峰。这里的百姓十分惊奇，一夜之间，大地上便长出一座高山，都不知道这高山是他们的国王变成的。这个国家的金果子落地，再也不发光了。
