针对上述弊端，左宗棠对甘肃盐务按原有情况采用了三种整理办法：“原有引课的，改引为票，课厘并增，这是用他在浙江和福建的成规；原有土盐税的，改征厘金；原没有税的，开征土盐税。”《左文襄公在西北》，第147页。同治末年，新改政策推行，改引为票、课厘并征的有：漳县盐井镇每斤收厘十三文；西和盐关镇每日煮盐一千三百斤，收厘十一串七百文，合每斤七文；花马大池每驼二百六十斤，收厘二串八十文；惠安堡每斗四十五斤，收厘四十文。前三处都是设局专征，后一处厘金局兼征。但各州县仍多把盐课摊入田赋。兰州府属土盐税，也于同治末年起停税征厘。甘、凉、肃三属于光绪元年起开征土盐税。这期间由于陇东出现了盐荒，盐价每斤涨到一百数十文，所以左宗棠专门修通了由固原到惠安堡的运盐之路。从同治十一年底到光绪六年底，左宗棠总共收“盐税和盐厘六万零八百六十两。这个数目太渺小了。其原因是甘肃的盐只销本省，而甘肃的人口又少，平日销盐的数量既有限，课厘的收入也不能旺了”《左文襄公在西北》，第147页。整理盐务收效并不显著。
（3）整顿茶课
关于西北茶叶贸易，前一节已从推进边贸发展的角度作了一些探讨，本节再从整理赋税的角度作些探究。由于西北茶叶的来源，除部分川茶外，大多来自湖南安化。左宗棠“早岁在安化陶澍家教了八年的书，那地方叫做小淹，恰是甘肃引商采购湖茶的中心。所以文襄公对于茶市情形，很是熟悉”《左文襄公在西北》，第149页。于是，左宗棠经过了长期的研究，就有了后来的整理方案。前述各地的茶商将茶叶运到陕西泾阳以后，压制成块称为砖茶，销陕、甘、青、新和西藏、蒙古等地。每引100斤，另带损耗14斤，课税有正课4两，杂课4种计1两4钱4分。当时，每年销28996引，收税128742两多。“这在贫乏的甘肃，不失为一个优厚的税源。”《左文襄公在西北》，第148页。可是，“甘省茶务，自军兴以后，商民流离，茶引停销，悬课无着”《左宗棠全集·札件》，第542页。，亟待整理。
于是，左宗棠于1872年（同治十一年）初，拟订茶务试办章程，以清积弊。同治十二年另拟改革章程，提出“以票代引”办法。1874年4月（同治十三年二月），左宗棠又向清政府提出《甘肃茶务久废请变通办理折》，指出：“盐可改票，茶何不可？”主张“以票代引”。每票50引，即5000斤，另带损耗70斤。每引纳正课银3两，杂厘1两4钱，至多不过2两，每票即需课厘计222两。“凡商贩领票，均先令纳正课。”凡“陕甘商贩有票运茶过境，茶厘减纳十分之八，只抽两成”，余则由各省划抵积欠甘饷。为了保护甘茶销售，对“无票私茶”和课税较轻的山西茶商入境，令其补领官票，“缴纳正课”，“照章完厘”《左宗棠全集·奏稿》（卷六），第4~14页。甘肃官茶运销新疆，每票加征厘金20两，课税100两。因此，新疆官茶每票要363两。
左宗棠改革甘肃茶务，改引为票，原来只有2000多引，改票后发票835票，每票50引，即有4万多引，税收达233400多两。改引为票虽极大地促进了西北茶叶贸易的繁荣，使茶课不断增加，但有些票经过10年仍有110多票未能销完，原因何在呢？据左宗棠在1877年（光绪三年）说：“陕甘茶政，其废弛之故，由于私贩充斥，官引滞销。而归化城之私贩则由蒙古假道俄边行销新疆，尽夺甘商引地。”私贩能行销，除假道俄边外，还在于“晋商成本轻，销售易，故获利独厚，无怪官茶运行口外钝滞异常”。左宗棠未从私贩成本轻，在市场上有竞争力出发，改革官茶成本重的问题，而是想以“具折切实陈之”的行政力量“禁之”《左宗棠全集·书信》（三），第224~225页。可见他没有从商品经济规则出发设法解决官茶在市场上的竞争能力问题。
（4）增设厘金
厘金是太平天国时期的产物。由钱江（字东平，浙江归安人）创议，始行于扬州仙女庙。钱江曾把这个建议向洪秀全条陈，未被采纳。清朝副都御史雷以諴采用以后，遂成为清军进攻洪秀全饷糈所依靠的最大税源。湖南仿办厘金最早，成绩也最好，这是左宗棠在巡抚骆秉章幕府中一手策划的。此后，左宗棠无论做闽浙总督，做陕甘总督，都根据他在湖南的经验，把整理厘金作为补充军饷的一个重要途径。
甘肃很早就开征厘金，不过收入不旺。据杨岳斌报告：“兰州省城也不过每月数千两，随收随用去。秦州虽较旺，然除去驻军开支，维持厘局费用本身还不够。”《左文襄公在西北》，第151页。为此，左宗棠在甘肃增设了一些厘金局。如先在秦州设陇南税厘总局，以后随着军事的进展，每占领一地，就开征或加征该地厘金。大致每府或直隶厅州治所，均设一厘局，其余所属地方设立关卡。例如宁夏府设一厘局，其下设有中卫、惠安堡、花马池、石咀山、横城堡、吴忠堡等卡，后来又在省城兰州设置全省税厘总局。另外在产盐中心或运盐要道专设厘局，征收盐厘。
甘肃初征厘金时（1866年），每月收银不过一二千两，此后大大增加，仅1870年至1881年的11年中，就收厘金906572两。连盐厘在内，每年要收八九万两，比以前增加数倍之多。厘局最多时，省内局卡林立，层层征收，往往一货数次完纳厘金后，犹苛索不已，致使本地小本商贾不堪忍受。秦安的商人曾为此举行罢市，要求停征。阶州的商人也有过类似的反抗活动。可见厘税之设，实有无穷流弊。
（5）举借外债
举借外债是左宗棠挽救甘肃财政危机的重要措施之一。洋务派官僚都认为举借外债是一条“锦囊妙计”。早在1865年，当左宗棠还在闽浙总督任内时，就曾向福州外商借银三十六万两。左宗棠来陇后，由于西征与经营西北所急需，他不得不忍受诸多苛刻条件，先后举借外债达六次之多。
第一次向英商汇丰银行和怡和洋行借款120万两，自1867年7月至12月，限期半年，月息一分二厘。
第二次向英商借款100万两，自1868年4月至12月，限期半年，月息一分二厘。
第三次向怡和洋行、丽如银行借款300万两，自1875年4月至1878年4月，限期三年，年息一分零五毫，每半年还本付息一次。
第四次向汇丰银行借款500万两，自1877年至1883年，限期七年，月息一分二厘五毫其中二厘五毫系作为给德商泰来洋行中介人的酬金。，每年还本付息一次。
第五次向华商组成的乾泰公司乾泰公司是左宗棠命买办胡光墉在上海仿照西方联合股份公司组成的。和英商汇丰银行借款350万两（双方各借175万两，即外债只175万），自1879年至1884年，限期六年，月息一分二厘五毫，每半年还本付息一次。以上五次借款，“统共一千一百九十五万两。”《左文襄公在西北》，第156页。
第六次向英商汇丰银行借款400万两，自1881年至1887年，年息九厘七毫五丝，前两年每半年只付息一次，第三年起每半年还本付息一次。这次借款时左宗棠已奉诏在京，因清政府答应拨给甘肃、新疆的每年五百万两的协饷没有着落，继任左宗棠的杨昌浚和刘锦棠不禁发愁，左宗棠不忍坐视，遂接洽了这一笔外债。以上六次外债，本金达1595万库平银两，成为近代第一次举债高潮期马陵合：《试析左宗棠西征借款与协饷的关系》，《历史档案》1997年第1期。
（6）举办捐输
捐输是中国历代封建政府以卖官鬻爵为内容而形成的一种筹资、捐款方式。清代咸丰以后，为了筹措军饷，捐输更为盛行，名目越出越奇，捐输款额越贬越低。一般富家子弟，为了显赫门楣，光宗耀祖，也竞相捐纳，趋之若鹜。办理捐输的委员则相与结托，到处兜售。于是官吏更加腐败昏聩，贪污现象更是骇人听闻。左宗棠对“捐输”非常重视，他一到甘肃，就着手整理，视为生财之道。甘肃交通不便，文化落后，为了广泛招徕，捐输曾一再减价。后要筹集军粮，捐银改为捐粮，继而又扩大到外省。当时，在西安设有甘捐总局，在秦州设立陇南分局。此外，又在福建、浙江、山西、河南、湖北、湖南、山东等省广设分局，委托各省捐局和布政使代办。省内省外，自办托办共有35处，形成了一个规模庞大的“捐输网”。
捐输定价是：知县1200百两，通判700余两……。一时商人地主子弟，纷纷跻身仕途，谋得一官半职。那些利禄熏心者，甚至组织所谓“股份公司”，由两人合捐一知县，约定将来到任后，官册无名者，则经管地丁钱粮。这样一来，僧多粥少，宦途拥挤不堪，有的为了找到一个差使，采取“内线进攻”，令内眷入藩署进行活动，奇闻丑事，四处流传，官场上的黑暗龌龊，不堪言状。怪不得秦翰才说捐输是我国“数千年文明史上的一大污点”《左文襄公在西北》，第152页。
甘肃的捐输从1869年（同治八年）6月开办，至1875年6月止。其中，直接办理部分所获捐输款7418907两，委托办理部分合银1309847两。这一笔款项在左宗棠的军费收入项下，约占9．4%。从近期来看，捐输解决了部分军费之急需，缓和了财政危机，又满足了一些士人争名求利的欲望，笼络了人心，暂时挽救了封建统治的危机。但从长远看，它大大加深了封建统治的腐朽，也大大加深了社会矛盾，是真正的“饮鸩止渴”之举。
（7）整理币制
左宗棠为了恢复市面活力，还整理过甘肃的币制。咸同年间，甘肃地方官员曾在省内先后自铸当千和当五百紫铜大钱，后来还加铸铁钱，发行钱钞，致使市面制钱消失，钞价大跌，引起了物价大涨，民生大困的局面。
同治十二年，左宗棠准备专门款项以收回钱钞。按当时市价，“以制钱六文抵钞一串。部钞部份，除官钱局呈缴四十万七千四百八十八串，又破烂无着五十七万七千五百三十三串外，实收回一万四千九百七十九串；司钞部分，除官钱局呈缴三十三万九千三百三十二串，又破烂无着者十八万三千六百四十四串五百文外，实收回八百三十七万七千零二十三串五百文。计付实银一万三千九百六十四两六钱，制钱二万九千四百零五串一百十五文。这件事安排在省城各地点同时办理，隔五天就办了，商民大欢，省城市面始有起色”《左文襄公在西北》，第157页。
左宗棠以善于理财自许，通过上面的论述可以看到，为了筹集足够的经费，左宗棠想尽了办法，从改革田赋、整理盐务、改茶引为票、增设厘金、整顿币制，到迫不得已举借外债，甚而至于通过卖官鬻爵搞捐输，目的都是为了增加收入以填补协饷之不足，为经营西北服务。但是，由于甘肃太贫困，经济太落后，导致他整理地方财税的努力，收效不很显著。仅以1874—1877年左宗棠西征款项的总收入为例（见下表），各种杂税（包括捐输）收入，在总收入中不到10%。而协饷几乎占总收入的一半。至于洋款和商款都是为填补协饷的缺额而筹借的，最终仍将由协饷划还。这样协饷实际上在总入款中所占的比例就接近80%，这充分反映了“以东南之协饷，赡西北之甲兵”的事实。洋款和商款合计超过30%，几乎占总收入的三分之一，也显示了这两笔入款的重要意义。而这些借款完全是由左宗棠自己想方设法筹集的。可见有些史家说左宗棠在军饷问题上“孤军奋斗”，不是没有根据的。对于左宗棠为用兵西北而举借外债，历来褒贬不同，其中功过是非虽难遽定，但仅从举债为维护国家主权、巩固西北边防而言，其爱国之心是显而易见的。他整理甘肃财税的工作也不应因成效太微而被忽视。
