肥胖会诱发高血压、高脂血症、冠心病、卒中（中风）等。可并发各器官、多系统的疾病。
1.血液循环系统疾病
由于脂肪组织中血管增多，有效循环血容量、心搏出量、输出量及心脏负担均增高，有时伴有高血压、动脉粥样硬化，进一步加重心脏负担，引起左心室肥大，更易引起心肌劳损，以致左心扩大与左心衰竭。同时肥胖者脂肪组织增多，耗氧量自然加大，心脏工作量亦相应增加，较易发生心肌梗死、心绞痛、冠心病、高血压、卒中和猝死等。
2.呼吸系统疾病
胸腹部脂肪较多时，腹壁增厚，横膈抬高，换气困难，故有二氧化碳滞留，缺氧以致气促，甚至发生继发性红细胞增多症，肺动脉高压，形成慢性肺心病而心力衰竭，肺泡低换气综合征，心肺功能衰竭，阻塞性睡眠窒息症等。
3.消化系统疾病
肥胖症者食欲多亢进，便秘、腹胀较常见。肥胖者有不同程度的肝脂肪变性而肿大，脂肪性肝病、胆囊结石、胆囊疾病的患病率亦因肥胖而有所增加。伴胆石症者有慢性消化不良、胆绞痛发作史。发生胆囊疾病是一般人的3倍。
4.内分泌代谢疾病
因内分泌代谢紊乱，空腹及餐后血浆胰岛素增高，既有高胰岛素血症，同时又存在胰岛素抵抗，造成糖耐量减低或糖尿病。肥胖者也因为尿酸的代谢较差，嘌呤代谢异常，血浆尿酸增加，使高尿酸血症与痛风症的发病率明显高于正常人。
5.骨与关节疾病
肥胖的另一大代价是导致骨关节炎，如膝和脚腕关节炎，其成因基于身体过度超重，而重量压迫的关系，骨及关节较容易受伤。
6.生育方面疾病
女性肥胖症的月经病发生率较高，女性肥胖者多闭经不育，说明性腺功能异常，可患多囊卵巢综合征，伴经少或闭经、多毛、男性化等症状。男性肥胖者性激素改变较明显，雌激素增多而雄激素减少，多有阳痿、不育、类无睾症。
7.精神心理疾病
由肥胖引起的心理问题容易为人忽略，肥胖者往往遭受嘲笑、偏见、歧视和不平等看待，可能影响其教育、就业、收入和婚姻关系，更甚者会导致抑郁、情绪失落和焦虑等精神困扰。
8.其他疾病
肥胖者皮肤上有淡紫纹或白纹，分布于臀外侧、大腿内侧、膝关节、下腹部等处，易磨损，引发皮炎、皮癣。还易并发多发性脂肪瘤。平时汗多怕热、抵抗力较低而易感染。某些癌症在肥胖者中更常见。包括女性的乳腺癌、子宫癌和卵巢癌，男性的结肠癌、直肠癌和前列腺癌等。
