不久，元帝派出自己的两个心腹担任要职，一个是擅长弹劾的刘隗，一个是善于奉承的刁协。宫中之事不论大小都委任他们两个去办理，有意疏远王导，王导对此冷遇泰然处之。
野心勃勃的王敦认为有机可乘，于是借口除奸起兵发难，刘隗立刻上书元帝，主张诛灭王氏九族，王导陷入困境。
也许有人会认为，王导和王敦是堂兄弟，可以合力夺取天下，这是天赐良机啊！
情形对朝廷很不利，但王导始终没有和王敦同流的念头，因为他的目标是使江南半壁江山安定。而司马氏是安定的象征，司马氏的存在具有利用价值，司马氏政权和各世族之间势力均衡，政治就可以维持安定。王氏一族没有必要扩张势力，更何况王敦有朝一日称王，依他的个性，自己也会面临大祸。
王导于是仰仗自己卓越的演技，翻手为云，覆手为雨，在夹缝中顽强地生存，并暗中操纵复杂多变的局面，是官场中的绝顶高手。
王导率领二十多位族人，每天在宫外磕头请罪。一天，他叫住了将要上朝的周凯：“大人！我们的事全仰仗您了。”
周凯毫不理会直接上朝，但见到元帝后，却称王导是忠心不二的贤臣，极力为他辩护，终于说服皇帝。当周凯退朝时，王导又叫住他，周凯仍然装作不理，但却转身向他的随从说：“今年我将大有可为，我要扫除贼党建功立业。”
周凯回家之后，又写了奏章。王导磕头谢罪说：“乱臣贼子历代皆有，王门出此逆贼，乃微臣不察之罪！”
元帝连忙扶起王导说：“爱卿！朕将国家大事重新委托给你。”并赐予“大义灭亲，一代忠臣”的诏书，又任命他为警备区司令。对元帝来说，他是靠王导才成功的，所以避免和王敦正面冲突。为了阻止内乱，下令处死奸臣刘隗和刁协。
元帝派重臣去和王敦谈判。王敦一看是周凯，就对他怒吼道：“你为何要背叛我？”
原来王敦曾救了周凯一命，周凯毫无惧色地说：“今天陷你于不义，实在是因为我背叛了你，但身为政府军司令，我无能为力。”
王敦知道周凯以后一定是个劲敌，为了找借口杀他，于是多次问王导。王导虽和周凯是同僚，但两人格格不入，于是始终沉默不语，这等于见死不救。
周凯死后，王导又痛哭流涕追念周凯，这完全是演戏。为了保存实力，树立自己的权势，王导表现了旷世罕见的演技。
王敦看什么也捞不上，班师回朝，而王导趁势把军政大权牢牢控制在自己手中。元帝死后，他奉命辅佐明帝，更加不可一世。
六亲不认剪除异己
王敦一直虎视眈眈夺取帝位，但是师从无名，不敢妄动。而王导却派兵探查王敦举动，暗中备战。
不久，明帝接到王敦病危的消息，于是立刻派王导率兵讨伐。王导在出发前，发布了王敦的死讯，要族人服丧，谁也不知道这是王导的计谋，而士兵们听了之后却奋勇争先，认为势在必得。
王敦派五万大军出击，结果大败，气愤而死。
叛乱失败后，按照法律规定，王氏一族理应受罚，但明帝下诏：“王导大义灭亲，应恕其罪至百代之后。”
论功行赏时，记王导大功一件，并封为始兴郡公，采邑三千户，赐绢九十匹。
苦心经营的威力
明帝27岁时英年早逝。成帝即位，年仅五岁，于是成帝生母庾太后的兄长庾亮辅佐年幼的皇帝。从此，朝政落入外戚之手，而庾亮借朝廷的权势，作威作福。
在这之前，王导执政，凡事以宽大为本，顺应民心，与人民自然的融合。不料庾亮执政后不断扩充庾氏与司马氏的势力，运用各种手段在朝中排除异己，因此造成了朝臣的不安。
在这种情况下，从前讨伐王敦有功的苏峻借口铲除外戚而起兵，占领都城建康，结果庾亮逃往西方，而汉成帝被困于石头城。苏峻并无夺取皇位的野心，只想挟天子以令诸侯，因为他只是个新崛起的军阀，还没有勇气与所有的贵族为敌。这时，王导苦心经营的官场发挥了威力。
苏峻眼见王导德高望重，关系网很大，实力雄厚，因此不敢轻举妄动，官阶也不敢超过王导，许多人建议他杀王导取而代之，苏峻却反而保护王导。
王导趁叛军内部不统一，利益不均矛盾多，派人说服苏峻归顺朝廷。自己迅速逃离石头城，举兵反攻，歼灭叛军，救出了汉成帝。
借刀杀人不露痕迹
平叛后，平叛有功的陶侃、温峤两将军俨然是军中强人，居功自傲，目中无人，但他们不敢留在国都，因为他们知道一旦离开军队，他们丝毫没有用武之地，很快就会被官场排挤、吞没。尽管他们有兵权，也奈何不了王导。
然而，他们究竟是军人，不懂得政治，因此处处表现出对王导的不满。
兵乱的战火尚未全熄，江苏又发生了重大事件。将军郭默因私怨而杀了刺史刘胤，李代桃僵，伪称钦命在身，但王导出于大局的考虑和郭默的英勇，只好正式任命郭默为江州刺史。
当时陶侃身在巴陵，获知案件发生，就想独自讨伐，但属下纷纷劝阻他：
“无论如何，郭默现在有钦命在身，是朝廷命官，若将军不经朝廷准许而私自发兵，后果不堪设想。”
“现在皇帝年幼，哪里有真正的钦命，都是因为王导软弱无能，以宽大的原则，而放纵郭默的结果。”
陶侃不顾众人的反对出兵，除了向王导通告他的行动，并责备王导处理不当：
“郭默杀了朝廷命官，却立刻任命他为江州刺史，既然如此，若谁想当宰相就把宰相杀了能行吗？哪里还有朝纲，哪里又有皇威呢？”
陶侃也曾经有过当皇帝的野心，因此这封信的内容含沙射影，不只是批评，还有其它的含意。
王导回答道：
“郭默占据着国都上游要塞，手中握有强大的军队，朝廷不得不隐忍一时，等郭默上任大意之时，再伺机谋取。今将军出马，可借此稳定朝纲，正是老夫期待已久的美事，将军功不可没。”
陶侃仍气愤地说：“这样首鼠两端，姑息养奸，岂不是眼睁睁地看着郭默尾大不掉吗？”
陶侃嘴上虽这么讲，内心却对王导的奉承感到无比欣慰。
以退为进姜还是老的辣
温峤、陶侃不久相继死去，庾亮复出，又一次被任命为大将军，掌握军政大权。如此一来，王导成为眼中钉，肉中之刺，于是庾亮和陶侃之子陶称共同谋划想夺去王导大权。有人向王导偷偷报告，王导却说：
“庾亮和我都是为国尽忠，都没有二心，若他真的对我不利，我也乐得退隐，别无选择，这又有什么值得忧虑的呢？”
另外他又写信给陶称：
“庾亮乃当今国舅，亦为国之元老，你要诚心诚意地服侍他。”
这样一来，不仅展示出王导的大度，也来了个先下手为强，抢先识破他们的阴谋，并且利用写信进行内部分化，手段巧妙、凌厉，不能不令人赞叹：“王导真是官场超级明星和超级杀手”。
庾亮的手下人也极力劝谏：
“王导深受众望，又没有任何野心，主公万不可轻举妄动，以防酿成大祸。”
炉火纯青的表演
王导六十四岁的时候在宰相任内去世。
他前后辅佐三个皇帝，经历了不少战乱和朝廷内部斗争，久经考验，在官场中始终立于不败之地，这全亏了他炉火纯青的表演。
王导一生致力于江南半壁的平稳和发展，为此他在官场中建立了一整套体系。如何才能把立场和利害，以及各种不同种族等方方面面的关系协调并团结起来呢？采取高压和铁血手腕，以力服人，最终将导致内乱。为了消除摩擦和内乱，牵着大家的鼻子走，他便采取了出色的演技手法。
你很难搞清楚，他究竟是谁？
一会儿他是忠臣，一会儿他是盟友，一会儿又是叛徒。和你并肩走的时候，冷不丁给你个小绊子；帮你推车的时候，又随手拔掉了你的气门芯。
晚年的王导，回顾一生时，透露了他真正的内心——大家批评我的作风太过离谱，并且骂我虚伪，是个多变的小人，但有朝一日，他们会对我重新评估一番的。
